OpenMPI为特定节点指定可执行文件

Question

我有一个异构计算集群，我希望在使用OpenMPI时运行并行计算任务。由于集群中的所有节点都不能运行相同的可执行文件(由于是异构的)，所以我希望某些节点编译自己版本的程序，并让Open在这些节点上调用该可执行文件。我的第一个问题是OpenMPI是否支持跨异构体系结构的这种计算。

如果是这样，我的第二个问题是如何指定在哪个节点上运行哪些可执行文件。例如，假设node0、node1和node2可以运行可执行文件prog1，node3、node4和node5可以运行可执行文件prog2，其中prog1和prog2是相同的程序，但是使用mpicc或mpic++包装编译器编译不同的体系结构。

如果我想在所有节点上并行运行该程序，我将执行以下操作：

mpirun -n 3 --hosts node0,node1,node2 prog1 : -n 3 --hosts node3,node4,node5 prog2

如果没有，我将做什么来达到这个效果呢？This post表示OpenMPI支持异构集群计算，但我必须使用--enable-heterogeneous标志构建OpenMPI。我不知道如何做到这一点，因为我的集群正在运行ArchLinux，我用pacman安装了OpenMPI。

Answer 1

注意，有一个错误(--host不需要结束s)，所以您的命令应该是

mpirun -n 3 --host node0,node1,node2 prog1 : -n 3 --host node3,node4,node5 prog2

--enable-heterogeneous是必需的，因此开放MPI可以在异构系统上运行(例如在Intel x86_64 (小endian)和sparcv9 (大端)节点之间)。如果OpenMPI (随ArchLinux一起来)没有配置此标志，那么您应该重新构建这个包。另一种选择是重新构建Open并将其安装到另一个目录中。

最后但并非最不重要的一点是，异构支持是(非常)容易测试的，我强烈鼓励您使用最新的OpenMPI3.0系列。