R中的python :找不到熊猫

Question

我试图通过结合R和Python的优点来改进我的研究。网状软件包是实现这一目的的一种很有前途的工具。但出了点问题..。

devtools::install_github("rstudio/reticulate")
library(reticulate)

py_available()

1假

py_config()

python: /usr/bin/python

libpython: /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/config/libpython2.7.dylib

pythonhome: /System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7:/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7版本: 2.7.10 (默认，2015年10月23日，19:19:21) GCC 4.2.1兼容苹果LLVM 7.0.0 (clang-700.0.59.5)

/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/numpy numpy_version: 1.8.1

python版本发现：

/usr/bin/python

/usr/local/bin/python

/usr/local/bin/python3 3

/User/User/anaconda/bin/python

use_python(" /Users/User/anaconda/bin/python")

我正在使用Anaconda的所有“数据科学包”。这就是选择相应的python版本的原因。所有必需的软件包都已安装完毕，并经常通过木星笔记本使用。

py_available() 

1真

是的，正如预期的那样！

py_module_available("pandas")

1假

由于某些原因无法使用(()

)预先谢谢你的想法()

案件的SessionInfo：

R版本3.4.1 (2017-06-30)平台: x86_64-apple-darwin15.6.0 (64位)，运行于: OS X El Capitan 10.11.6

矩阵产品:默认BLAS: /System/Library/Frameworks/Accelerate.framework/Versions/A/Frameworks/vecLib.framework/Versions/A/libBLAS.dylib LAPACK: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/lib/libRlapack.dylib

区域设置:1 ru_RU.UTF-8/ru_RU.UTF-8/ru_RU.UTF-8/C/ru_RU.UTF-8/ru_RU.UTF-8

附加的基本包:1个stats图形、grDevices实用程序、数据集、方法库

其他附加包裹:1 reticulate_1.1.0.9004

通过命名空间加载(未附加)：1 httr_1.3.1 compiler_3.4.1 R6_2.2.2 tools_3.4.1 withr_2.0.0 curl_2.8.1 memoise_1.1.0

8 Rcpp_0.12.12 git2r_0.19.0 digest_0.6.12 jsonlite_1.5 devtools_1.13.3

Answer 1

我认为你必须在打电话给use_python 之后立即给library(reticulate)打电话，在py_config或其他任何事情之前。

对我起作用了。这个问题的更多细节：Importing python module in R

Answer 2

您需要设置函数的第二个参数，因此它应该是：

For expample use_python("/users/my_user/Anaconda3/python.exe",required = TRUE)

不要忘记所需的=真