在Ubuntu 16.04上从源代码构建时在配置过程中设置R库目录

Question

在Ubuntu 16.04上使用这些命令构建R

wget http://cran.r-project.org/src/base/R-3/R-3.4.1.tar.gz
tar -xzf R-3.4.1.tar.gz
cd R-3.4.1; ./configure --prefix=/usr/local --enable-R-shlib; make; make install

导致将R库设置为/usr/local/lib/R/库

而使用“apt安装r-base”安装R则将包安装到/usr/local/lib/r/site-库中。

是否有从源构建将创建/usr/local/lib/R/站点库的配置选项？

Answer 1

您可能会混淆顶层目录的编译时选项和运行时选项/配置时选项。

在编译时，您只能像以前一样通过--prefix设置顶层。

在运行时(即启动或会话期间)，您可以为.libPath()设置library()。对于Debian / Ubuntu，我们在/etc/R/Renviron中这样做：

# edd Apr 2003  Allow local install in /usr/local, also add a directory for
#               Debian packaged CRAN packages, and finally the default dir
# edd Jul 2007  Now use R_LIBS_SITE, not R_LIBS
R_LIBS_SITE=${R_LIBS_SITE-'/usr/local/lib/R/site-library:/usr/lib/R/site-library:/usr/lib/R/library'}

你可以根据你的心愿定制它。见help(Startup)。