GraphViz的可执行文件未找到: Anaconda-3

Question

我试图显示树的输出，但是当我运行下面的脚本时，我会收到一个错误，如下所示：

InvocationException:找不到图形not的可执行文件

我在这里搜索过类似的主题，但大多数都是与Mac相关的。我使用Windows 10 64位操作系统，我使用Anaconda-3 64位.我很想听听你对此的建议。

#Displaying the decision tree
from sklearn import tree
#from StringIO import StringIO
from io import StringIO
#from StringIO import StringIO 
from IPython.display import Image
out = StringIO()
tree.export_graphviz(classifier, out_file=out)

import pydotplus
graph=pydotplus.graph_from_dot_data(out.getvalue())
Image(graph.create_png())

编辑:我又安装了graphviz和pydotplus模块，但现在还在工作。

Answer 1

我也有同样的问题。以下是(Win10，Anaconda3，木星笔记本，python3.x)的解决方案

1. 下载和安装windows.html
2. conda安装图
3. 向“控制面板”>“系统和安全”>“系统”>“高级系统设置”>“环境变量”>“路径”>“编辑”>“新建”中添加已安装路径(C：.\ graphviz \bin)
4. 非常重要:重新启动你的木星笔记本/机器。我试过重新启动机器，结果成功了。

这个问题是针对不同的操作系统回答的：Graphviz's executables are not found (Python 3.4)

Answer 2

我也有类似的问题。和Vamshi一样，我也有类似的Win10系统。我的规范；基于Win10，x64的系统，Anaconda3，AnacondaNavigator1.9.6，Python3.7(确切地说，是Spyder3.3.3)。

我的解决方案还涉及编辑PATH环境变量。这是一个循序渐进的计划：

1. 导航到Anaconda资源管理器窗口中的“Environment”选项卡。你应该能够在屏幕的左上方找到它。
2. 选择要在其中安装GraphViz包的相关环境。对于大多数用户来说，这只是“基本(根)”环境。
3. 一旦您选择了要安装GraphViz的环境，请单击环境名称右侧的播放符号(例如"base (root)“)。应该弹出许多选项。只需从下拉菜单中选择“打开终端”选项。
4. 当您单击“打开终端”时，将在您的环境的正确位置打开命令提示符。输入以下代码；

conda install graphviz

PS:您也可以使用pip安装graphviz，但根据我的经验，它可能会导致与使用conda安装的其他模块发生冲突。

1. Anaconda现在将下载Graphviz包，并检查其与所有已安装的其他包的兼容性。请耐心等待，这可能需要一些时间取决于您的系统和互联网连接。
2. 安装完成后，退出Command提示符并返回您安装了Graphviz的环境(可能是"base (root)")。从下拉菜单中选择“安装”选项到“通道”下拉菜单的左侧。在搜索框中选择正确的"graphviz“类型，并检查软件包是否已成功安装在您选择的环境中。
3. 现在完成了，打开一个使用Graphviz特性的.py脚本并执行该脚本。您很可能仍然会看到这样的警告消息：“GraphViz的可执行文件未找到”。在警告消息中，将给出特定的文件位置地址。对我来说，这个文件的位置是"C:\Users\David\Anaconda3\Library\bin\graphviz“，但它很可能是不同的，这取决于您的安装过程和计算机的设置。请确保复制此文件路径。
4. 现在我们需要编辑系统的环境变量。这里要非常小心。首先，只需按下Windows键就可以打开开始菜单。然后，只需键入“环境变量”。Windows应该给您的第一个建议是：“编辑系统环境变量”。单击此链接。
5. 现在，您应该在系统属性菜单的“高级”选项卡上。单击此菜单底部的“环境变量”按钮，->选择新菜单中的路径，->单击“编辑”->，单击此框中的“新建”->，粘贴来自->警告框的链接。对我来说，这是"C:\Users\David\Anaconda3\Library\bin\graphviz“，但可能不一样。按回车。
6. 新的行应该出现在您的路径菜单与您刚刚输入的确切地址。
7. 关闭所有程序并重新启动您的PC。这是新途径生效所必需的。
8. 重新打开Anaconda，选择安装了GraphViz的环境，然后从Anaconda中运行Spyder。
9. 重新运行使用.py特性的GraphViz脚本。错误消息应该已经消失，并且包应该按照预期工作。

Answer 3

Vermundir的回答帮助解决了我的问题。

但是，关于步骤9，您需要确定要输入的正确路径。在我的例子中，Python错误不包含任何路径。要找到anaconda3中bin目录的正确路径(需要在其中追加\graphviz)，请在ipython上运行以下2行代码：

import os
os.environ 

通过扫描os.environ的输出，您将在“path”列表下找到anaconda3 bin目录的路径。例如，您可能会找到这样一条路径：

C:\\Users\\your_username\\AppData\\Local\\Continuum\\anaconda3\\Library\\bin

然后将\graphviz追加到该路径，如下所示：

C:\Users\your_username\AppData\Local\Continuum\anaconda3\Library\bin\graphviz 

当您单击"New“时，这是您在步骤9中输入的路径。