固定R包版本

Question

您如何在R中最好地销包版本？

拒绝策略1: Pin到CRAN源tar.gz的

• 如果您想将其固定在最新版本，则无法工作，因为CRAN没有将提示版本放在归档文件中(duh)

拒绝策略2:使用devtools

• 不想这么做，因为编译和添加许多我不想使用的东西需要很长时间

拒绝策略3:供应商

• 宁愿避免复制所有的源

Answer 1

为了提供关于packrat的更多信息，我将为此目的使用它。来自网站。

包依赖关系可能会令人沮丧。您是否曾经使用过试用和错误的方法来确定您需要安装哪些R包才能使其他人的代码工作--然后在全球范围内永久安装了这些软件包，因为现在您不确定是否需要它们？您是否曾经更新过一个包以使其中一个项目中的代码工作，结果发现更新后的包会使另一个项目中的代码停止工作？ 我们建造包装来解决这些问题。使用packrat使您的R项目更多： 隔离:为一个项目安装一个新的或更新的包不会破坏其他项目，反之亦然。这是因为packrat为每个项目提供了自己的私有包库。便携:轻松地将项目从一台计算机传输到另一台计算机，甚至跨越不同的平台。Packrat使安装您的项目所依赖的软件包变得很容易。可复制性: Packrat记录您所依赖的确切包版本，并确保这些确切的版本是在任何地方安装的版本。

Packrat存储您在packrat.lock文件中使用的包的版本，然后在您使用packrat::restore()时从CRAN下载该版本。它的重量比devtools轻得多，但仍然需要一些时间重新下载所有的软件包(取决于您正在使用的包)。

如果您喜欢将所有的源存储在一个zip文件中，可以使用packrat::snapshot()来解压源/更新packrat.lock，然后使用packrat::bundle()将所有内容“捆绑”起来。这样做的目的是通过存储原始设计中使用的包版本和依赖项(以及源代码，从而避免操作系统对二进制文件的依赖)，使项目/研究随着时间的推移可重复和可移植。

在我链接到的网站上有更多的信息，您可以在git回购上看到当前的活动。我遇到过一些不太理想的情况(不是CRAN上的包有时会有一些问题)，但git回购似乎仍然相当活跃，问题/补丁是令人鼓舞的。