库中错误(Qdap)：没有名为“qdap”的包

Question

我安装了qdap：

install.packages("qdap")

需要一段时间才能加载所有的内容，但是控制台会填满所有的下载，最后我会收到这样一条消息：

Warning in install.packages :
  installation of package ‘qdap’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
    ‘/tmp/RtmpeTzuKz/downloaded_packages’
> library(qdap)
Error in library(qdap) : there is no package called ‘qdap’
> 

因此，This让我尝试添加dependencies = TRUE，但问题仍然存在。

以下是会话信息

sessionInfo():
> sessionInfo()
R version 3.4.0 (2017-04-21)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
Running under: Ubuntu 16.04.2 LTS

Matrix products: default
BLAS: /usr/lib/openblas-base/libblas.so.3
LAPACK: /usr/lib/libopenblasp-r0.2.18.so

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C               LC_TIME=en_US.UTF-8       
 [4] LC_COLLATE=en_US.UTF-8     LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
 [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                  LC_ADDRESS=C              
[10] LC_TELEPHONE=C             LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.4.0 tools_3.4.0   

我昨天发现的另一篇文章(现在谷歌搜索找不到)建议我删除库目录中现有的qdap文件，关闭会话，重新启动和重新安装。没有确切的名为qdap的包，但有些包的名称是qdap，我删除了它。我的问题仍然存在，我无法安装qdap。

我不知道还能提供什么信息？任何帮助都很感激。

以下是试图安装qdap时生成的错误：

./配置:第3736行: /usr/lib/jvm/default- Java /jre/bin/java:没有这样的文件或目录，也没有配置:错误:java解释器'/usr/lib/jvm/default-java/jre/bin/java‘没有工作错误:rJava包配置失败*删除install.packages中的rJava警告:安装包’rJava‘具有非零退出状态。错误:依赖项“rJava”无法用于包“openNLPdata”*删除install.packages中的openNLPdata警告:安装“openNLPdata”包具有非零退出状态错误：“xlsxjars”包无法使用依赖项“rJava”*删除install.packages中的openNLPdata警告:安装包‘xlsxjars’有非零退出状态错误:附件‘rJava’不可用于包‘venneuler’*删除install.packages中的install.packages警告:安装包‘venneuler’具有非零退出状态错误:依赖项‘openNLPdata’，“rJava”不适用于包“openNLP”*删除install.packages中的openNLP警告:安装“openNLP”包存在非零退出状态错误:依赖关系‘rJava’，‘’xlsxjars‘无法用于包’xlsx‘*删除install.packages中的install.packages警告:安装包’xlsx‘具有非零退出状态错误:依赖项’openNLP‘、’venneuler‘，“‘xlsx”无法用于包“qdap”*在install.packages中删除install.packages警告：“qdap”包的安装具有非零退出状态。

由于这看起来像rJava问题，我找到了this帖子，并在终端上尝试了最上面的投票答案：

apt-get install r-cran-rjava

结果是：

E: Could not open lock file /var/lib/dpkg/lock - open (13: Permission denied)
E: Unable to lock the administration directory (/var/lib/dpkg/), are you root?

我希望有一种不用做根用户的解决方法？我对linux不太熟悉。我能安装其他的p包。

Answer 1

当您没有根访问权限时，有解决此问题的方法。

1. 下载Java (确保安装JDK)并在$HOME中安装它 您可以这样做，因为Oracle只是一个tar.gz包
2. 确保设置JAVA_HOME 导出JAVA_HOME=$HOME/opt/my_jdk_installation
3. 一旦有了Java，就必须重新配置R 只需告诉R您的Java在哪里 R CMD javareconf \ JAVA_HOME=${JAVA_HOME} \JAVA=$}/bin/java\ JAVAC=${JAVA_HOME}/bin/javac \ JAVAH=${JAVA_HOME}/bin/javah \ JAR=${JAVA_HOME}/bin/jar \JAVA=$\ JAVA_CPPFLAGS="-I${JAVA_HOME}/include -I${JAVA_HOME}/include/linux“

从现在起，R应该使用您个人安装的Java。这样，您就不依赖sys管理员了。