带有“`cimport”的Cython失败

Question

类似的问题已经问了很多很多次了，但不幸的是，我再次遇到了在Numpy中使用Cython的问题。以这个最小的例子为例(它与示例这里大致相同)：

# file test.pyx
import numpy as np
#cimport numpy as np

def func():
    print("hello")

我试着用：

from distutils.core import setup
from Cython.Build import cythonize
import numpy as np
import os

os.environ["CC"] = "g++-7"

setup(
    ext_modules = cythonize("test.pyx", include_path = [np.get_include()])
)

这个示例(python setup.py build_ext --inplace)起作用，直到我取消注释cimport ...行，然后我得到了一个众所周知的错误：

致命错误: numpy/arrayobject.h:没有这样的文件或目录

np.get_include()返回的路径确实有arrayobject.h头，但在执行的实际g++命令中，包含dir作为-I/...缺少。

g++-7 -Wno-未使用-结果-比较-代码-fno-共同的-dynamic -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -W严格-原型-i/usr/local/local/opt/openssl/include-i/usr/local/sqlite/include -c test.c -o构建/tem.macosx-10.11-x86_64-3.6/test.o

知道是什么导致了这个问题吗？

我在Mac上使用Python3.6.1 (Cython，Numpy，.)安装了pip3和Cython0.25.2。

Answer 1

而不是简单的cythonize命令，请使用

ext_modules = cythonize((Extension("test", sources=["test.pyx"], include_dirs=[np.get_include()], ), ))

include_dirs选项在这里给出了“扩展”，而不是使用带有"cythonize“的include_path。

Answer 2

我的解决办法：

os.environ["C_INCLUDE_PATH"] = np.get_include()
setup(
    ext_modules = cythonize("test.pyx")
)