你能通过R- Reticulate安装Python包吗？

Question

我将在R中创建一个python接口，并使用Reticulate包。为了访问R中的python函数，需要安装相应的python包。

我想到了两个问题：

1)如果使用网状包，需要安装Anaconda软件包吗？或者仅仅安装python包就足够了吗？

2)是否可以在R中安装类似于install.packages("r_package")的python包？

有人有这个话题的经验吗？提前感谢！

Answer 1

我将在前面的答案中添加一点细微差别。

就像@f0nzie说的，Anaconda不是包，而是包管理器。理想情况下，您将使用Anaconda创建一个环境来协助您的包管理和版本控制。conda环境的文档是这里。

现在，您可以在R中将python包安装到您的anaconda包中，这是可以使用reticulate::conda_install(envname, packages)实现的。conda_install()的文档可以找到这里。

Answer 2

1) R包reticulate可以使用默认的python，也可以使用Anaconda2或Anaconda3。如果您希望Anaconda与R一起工作，您必须首先安装Anaconda。一旦安装完毕，就可以调用library(reticulate)，并运行py_config()或reticulate::py_discover_config()，这将为您提供reticulate::py_discover_config()安装所使用的路径和环境列表。然后，一旦您了解了Python，就会添加一条类似于这个use_python("/opt/miniconda2/bin/python")的行，就在library(reticulate)之后，您就已经在做生意了。

2)要安装Python包，以便R (或网状)能够看到它们，您必须将它们作为常规的Python包从终端或控制台安装；而不是R。例如：conda install numpy安装numpy，或conda install scipy安装scipy，等等。

我只是在一个码头容器rocker/rstudio中做这一切。在标准操作系统中，它应该更容易一些。

下面是一步步的说明：rstudio网状

干杯!

Answer 3

如果您需要一个特定版本的Python，然后将==放在模块名称之后，例如，下面将使用pip安装3个模块的特定版本：

reticulate::conda_install(c("PyMuPDF==1.14.20", "PyPDF2==1.26.0", "reportlab==3.5.23"),
                            envname = "myenv", pip = TRUE)