当有许多名称时，MATLAB热图树状图没有显示列名

Question

我根据三种不同的实验条件(阿尔法、贝塔和伽马)列出了每种蛋白质的蛋白质和值。包含这些值的数组称为“heatmap_data”。蛋白质的名称在一个名为“text”的数组中。

我生成了一个热图：

rows = ['ALPHA' ;'BETA '; 'GAMMA']
rowscell = cellstr(rows)
dm=DataMatrix(heatmap_data,rowscell,text);
cg = clustergram(dm,'Standardize','none');
cgAxes =plot(cg);
set(cgAxes, 'Clim', [-1,1])

当蛋白质列表很短时，我得到了预期的热图，显示了x轴的标签。

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然而，当列表扩展到几百个时，名字就消失了。

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我能理解标签可能不适合在短的空间，但如果它们是写的，我可以减少字体大小，或扩大树状图等。

我的问题是:是否有一种方法可以强迫MATLAB显示列名，即使它们是重叠的，或者一个函数，我可以按照树状图的顺序保存名称，这样我就可以识别每个簇中有哪些蛋白质？

谢谢

Answer 1

好的，我找到了这个：https://www.mathworks.com/help/bioinfo/ref/clustergram.html

数字的RowLabelsValue向量或字符向量的单元格数组来标记树状图和热图中的行。默认值是值1到M的向量，其中M是数据中的行数。注意： 如果行标签的数目为200或更多，则除非放大，否则标签不会出现在群集图中。

现在，如果我放大，我可以看到名字。