安装ncdf4包:错误，nc-config未找到或不可执行

Question

我试过安装ncdf4软件包。我有R版本3.1.1。

问题似乎在于找到nc-config。如果我搜索这个特定的问题，那么我会发现有同样问题的人，他们通过在安装libnetcdf-dev之前安装Debian软件包ncdf4来解决这个问题。

我已经安装了那个包，但我一直有同样的问题，

错误如下：

checking for nc-config... no
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Error, nc-config not found or not executable.  This is a script that comes with the netcdf library, version 4.1-beta2 or later, and must be present for configuration to succeed.

Answer 1

正如评论中提到的@PaulHiemstra，查找nc-config的位置：

你能做的就是打开一个新的终端并做which nc-config。这将显示文件在系统中的实际位置。如果确实安装了这个文件，问题可能是Linux将它安装在给定的位置，而R希望它在其他地方安装(例如/usr/local/bin vs /usr/bin )。您可以尝试通过将包含nc-config的库添加到PATH环境变量中来解决此问题。或者问题可能是不相关的，例如32位对64位。

对我来说，这就是：

ubuntu@dark-horse:~$ which nc-config 
/home/ubuntu/miniconda3/bin/nc-config

首先，使用以下命令安装netcdf要点

sudo apt-get install r-cran-ncdf4

上面的命令应该已经安装了not，如果不尝试的话：

sudo apt-get install netcdf-bin

现在，下载netcdf4源代码

wget http://cirrus.ucsd.edu/~pierce/ncdf/ncdf4_1.13.tar.gz

现在，尝试进行安装。

sudo R CMD INSTALL ncdf4_1.13.tar.gz --configure-args="--with-nc-config=/home/ubuntu/miniconda3/bin/nc-config"

Answer 2

我有一个类似的问题，这些答案对我来说不太管用(Ubuntu16.04.4LTS)。

我不得不使用以下方法安装开发人员版本：

sudo apt-get install libnetcdf-dev

Answer 3

在CentOS 7上，在终端中使用sudo yum install netcdf-devel.x86_64完成了这个任务。