首页
学习
活动
专区
圈层
工具
发布
社区首页 >问答首页 >为什么在circlize初始化时会出现这个xlim错误?

为什么在circlize初始化时会出现这个xlim错误?
EN

Stack Overflow用户
提问于 2021-04-09 04:39:21
回答 1查看 18关注 0票数 0

我想用circlize初始化一个新的chord图,但我得到了一个错误,考虑到我输入的数据,这个错误似乎没有任何意义:

代码语言:javascript
复制
Error: Since `xlim` is a matrix, it should have same number of rows as the length of the level of `sectors` and number of columns of 2.

我理解这个要求,但是当我尝试生成不同的图时,它对一些人来说是失败的,但对另一些人来说却不是。下面是相关的代码片段,以及一些用于调试的输出

代码语言:javascript
复制
dev.new()                                                                       
circos.clear()            
circos.par(cell.padding=c(0,0,0,0), track.margin=c(0,0.01), gap.degree=1)                                     
xlim = cbind(0, regionTotal) 
print(class(region))                                                   
print(length(region))                                                           
print(class(xlim))                                                              
print(dim(xlim))                                                                                                                                                                                       
circos.initialize(factors=region, xlim=xlim)

工作正常的绘图的输出:

代码语言:javascript
复制
[1] "character"
[1] 24
[1] "matrix" "array" 
[1] 24  2

对于返回错误的代码:

代码语言:javascript
复制
[1] "character"
[1] 50
[1] "matrix" "array" 
[1] 50  2
Error: Since `xlim` is a matrix, it should have same number of rows as the length of the level of `sectors` and number of columns of 2.

我知道这些问题:this one led me to check the class

and this one led me to check my circlize version (0.4.11)

我错过了什么?感谢您能提供的任何帮助。

EN

回答 1

Stack Overflow用户

发布于 2021-04-10 20:42:03

在反复尝试之后,我发现了问题:我的区域变量(circos.initialize中的因子或扇区条目)中有一个重复值,因此有效扇区数低于变量的维度。希望没有其他人会愚蠢到犯这个错误,但以防万一,如果他们遇到这个错误,现在他们可以有一个额外的东西来检查。

票数 0
EN
页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/67011564

复制
相关文章

相似问题

领券
问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档