OpenIMAJ库不能读取tiff文件？

Question

我正在使用OpenIMAJ库，它很好地工作在"JPEG“和"PNG”文件上，但是对于tiff文件，它给了我一个错误。以下是代码：

import org.openimaj.image.ImageUtilities;
import org.openimaj.image.MBFImage;

....

File file = new File("/home/mosab/Desktop/input/tif.tif");
MBFImage input = ImageUtilities.readMBF(file);

这是一个错误：

Exception in thread "main" java.io.IOException: org.apache.sanselan.ImageReadException: Tiff: unknown compression: 7
    at org.openimaj.image.ExtendedImageIO.read(ExtendedImageIO.java:189)
    at org.openimaj.image.ExtendedImageIO.read(ExtendedImageIO.java:126)
    at org.openimaj.image.ImageUtilities.readMBF(ImageUtilities.java:355)
    at org.mosab.TestOpenIMAJ.TestKmeans.main(TestKmeans.java:49)
Caused by: org.apache.sanselan.ImageReadException: Tiff: unknown compression: 7
    at org.apache.sanselan.formats.tiff.datareaders.DataReader.decompress(DataReader.java:135)
    at org.apache.sanselan.formats.tiff.datareaders.DataReaderStrips.readImageData(DataReaderStrips.java:96)
    at org.apache.sanselan.formats.tiff.TiffImageParser.getBufferedImage(TiffImageParser.java:505)
    at org.apache.sanselan.formats.tiff.TiffDirectory.getTiffImage(TiffDirectory.java:163)
    at org.apache.sanselan.formats.tiff.TiffImageParser.getBufferedImage(TiffImageParser.java:441)
    at org.apache.sanselan.Sanselan.getBufferedImage(Sanselan.java:1264)
    at org.apache.sanselan.Sanselan.getBufferedImage(Sanselan.java:1163)
    at org.apache.sanselan.Sanselan.getBufferedImage(Sanselan.java:1136)
    at org.openimaj.image.ExtendedImageIO.read(ExtendedImageIO.java:187)
    ... 3 more

这是我正在使用的tiff文件(特别是GeoTiff)：

"https://drive.google.com/file/d/0ByKaCojxzNa9MWxPTUJjZURHR1E/view?usp=sharing“

这是否意味着OpenIMAJ库不支持tiff格式/GeoTiff？

我假设OpenIMAJ不支持tiff，所以我尝试使用"TwelveMonkeys“库来读取该文件。"TwelveMonkeys“库单独/单独能够读取文件。因此，我导入了TwelveMonkeys库，以便与OpenIMAJ一起工作，从而支持tiff文件，这对一些tiff文件有效，但对于该文件却不起作用(尽管"TwelveMonkeys“能够在单独的项目中单独读取它)，我得到了这个例外：

Exception in thread "main" java.io.IOException: Resetting to invalid mark
at java.io.BufferedInputStream.reset(BufferedInputStream.java:448)
at org.openimaj.image.ExtendedImageIO.read(ExtendedImageIO.java:185)
at org.openimaj.image.ExtendedImageIO.read(ExtendedImageIO.java:126)
at org.openimaj.image.ImageUtilities.readMBF(ImageUtilities.java:355)
at org.mosab.TestOpenIMAJ.TestKmeans.main(TestKmeans.java:49)

稍后，当我跟踪错误消息时，我发现可能与文件的大小有关，因为它大约是26 may ，并且我注意到错误来自类"org.openimaj.image.ExtendedImageIO“的”读取“方法，我认为它使用的是最大10 may的大小。

public static BufferedImage read(InputStream input) throws IOException {
    if (input == null) {
        throw new IllegalArgumentException("input == null!");
    }

    final NonClosableInputStream buffer = new NonClosableInputStream(input);
    buffer.mark(10 * 1024 * 1024); // 10mb I think here is the problem

    BufferedImage bi;
    try {
        bi = readInternal(buffer);
    } catch (final Exception ex) {
        bi = null;
    }

    if (bi == null) {
        buffer.reset();
        try {
            bi = Sanselan.getBufferedImage(buffer);
        } catch (final Throwable e) {
            throw new IOException(e);
        }
    }

    return bi;
}

那么，我如何解决这个问题并在OpenIMAJ中读取这个tiff文件(为了进一步应用OpenIMAJ提供的工具，就像集群/分段一样)？

Answer 1

TIFF是一种可怕的格式，因为它有许多自定义扩展，而库并不总是支持这些扩展。OpenIMAJ试图通过使用一批不同的库来解决其中的一些问题，以便读取各种不同的图像，但是在这种情况下，它失败了。正如您已经注意到的，存在一个10 be缓冲区限制，这会导致问题--将其增加到100 be允许加载您链接的映像。我将更新代码以解决这个问题(因为它只是一个限制，因此底层缓冲区似乎要小得多，因此不会造成任何问题)。

在部署新快照之前，您可以加载链接到以下内容的映像：

MBFImage img = ImageUtilities.
    createMBFImage(Sanselan.getBufferedImage(new File("tif.tif")), false);

似乎有一个单独的问题，Sanselan似乎无法加载您的所有图像(基于堆栈跟踪引用未知图像压缩)。如果您可以在GitHub bug报告(https://github.com/openimaj/openimaj/issues/119)上提供到这样一个映像的链接，那么可能会在使用TwelveMonkeys对此类图像使用TwelveMonkeys的回退中编写代码，或者我们可以看到更新版本的Sanselan是否修复了这个问题。同时，您可以对代码中的这些图像直接使用TwelveMonkeys，并使用上面的ImageUtilities将其转换为MBFImage。