无法将“bool”转换为“gzFile {aka gzFile_s*}”

Question

我对Linux环境很陌生，并试图安装一个生物信息学包(vcftools - https://vcftools.github.io/examples.html)。出于某种原因，我可以在Cygwin环境中进行编译，其他同事已经安装了这个包，但如果我试图在同一台计算机上的VirtualBox中编译Ubuntu环境，则会得到一个错误(如下所示)。我得到以下错误。有人对如何解决这个错误有建议吗？

$make安装

输出

Installing VCF tools
make[1]: Entering directory '/home/wde/selt/selectionTools/vcftools_0.1.11/cpp'
g++ -c -O2 -D_FILE_OFFSET_BITS=64  vcftools.cpp -o vcftools.o
g++ -MM -O2 -D_FILE_OFFSET_BITS=64  vcftools.cpp > vcftools.d
g++ -c -O2 -D_FILE_OFFSET_BITS=64  bcf_file.cpp -o bcf_file.o
g++ -MM -O2 -D_FILE_OFFSET_BITS=64  bcf_file.cpp > bcf_file.d
g++ -c -O2 -D_FILE_OFFSET_BITS=64  vcf_file.cpp -o vcf_file.o
vcf_file.cpp: In constructor ‘vcf_file::vcf_file()’:
**vcf_file.cpp:25:13: **error: cannot convert ‘bool’** to ‘gzFile {aka gzFile_s*}’ in assignment**
  gzvcf_in = false;
             ^~~~~
Makefile:53: recipe for target 'vcf_file.o' failed
make[1]: *** [vcf_file.o] Error 1
make[1]: Leaving directory '/home/wde/selt/selectionTools/vcftools_0.1.11/cpp'
/bin/sh: 2: cd: can't cd to perl
Makefile:24: recipe for target 'install' failed
make: *** [install] Error 2
error with make

Answer 1

makefile所做的基本上是自动化对编译器的调用。因此，makefile的输出类似于通常的编译错误，从命令行中编译源文件。上面错误日志中的重要一行是：

vcf_file.cpp:在构造函数‘vcf_file：：vcf_file()’中： **vcf_file.cpp:25:13：**error:无法在赋值** gzvcf_in =false中将‘bool’**转换为‘gzFile {aka gzFile_s*}’；

gzvcf_in是pointer to gzFile_s型的。将bool变量分配给指针类型将不会编译。因此，错误消息。将vcf_file.cpp中的false替换为指针文本std::nullptr或宏NULL，然后重新运行makefile。

顺便说一句。我从vcf中检查了github中的file.cpp文件。它们不包含导致上述错误的行。您可能有一个过时的/修改的版本，引入编译器错误。