构建使用RcppArmadillo、RcppEigen并依赖于Cpp11插件的R包

Question

我遵循了到目前为止在这个网站上解释的所有程序，或者德克、哈德利或其他人发表的笔记。然而，由于与cpp11插件有关的问题，我在构建包时仍然存在问题。

我使用了RcppArmadillo.package.skeleton()函数。我将cpp文件放在src目录中。命名空间文件看起来像它应该包含的importFrom(Rcpp, sourceCpp)行。我还编辑了描述文件，并在LinkingTo部分中添加了RcppEigen和我使用的其他包。我终于在R中运行了compileAttributes(verbose=TRUE)函数，一切看起来都很好。因此，我想我已经做了我应该做的一切。我还必须指出，当我使用sourceCpp()在R中编译我的代码时，它工作得很完美，而且编译时没有错误！为了更好地说明我的依赖项是什么，我将代码的第一个块放在这里：

    #include <RcppArmadillo.h>
    #include <RcppNumerical.h>
    #include <RcppArmadilloExtensions/sample.h>
    #include <Eigen/LU> 
    #include <algorithm>

    // [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]
    // [[Rcpp::depends(RcppEigen)]]
    // [[Rcpp::depends(RcppNumerical)]]
    // [[Rcpp::plugins(cpp11)]]

问题是，当我构建我的包，并得到错误和警告的行，我有auto类型，这涉及到cpp11插件。

在这个网站上搜索了类似的帖子后，我得出结论，我必须强迫我的R编译器使用c++11，因此我编辑了位于~/.R/Makevars的Makvars文件，并且由于我使用了CXX=clang++ -std=c++11，所以我在该文件中添加了一行：CXX=clang++ -std=c++11。但是，当我这样做时，这3个错误消失了，但是50个新的错误被生成，因为所有的Armadillo变量类型，如mat、uvec等等都不再被识别了。所以我不知道怎么解决这个问题。

我认为，基本上，使用// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]应该处理它，因为新版本的Rcpp支持这个插件，这可能就是为什么当我在R中运行sourceCpp时，没有任何错误，而且一切看起来都很好。但我不知道制作包裹的时候会发生什么。我的Rcpp版本是0.12.8。预先感谢您的任何帮助。

Answer 1

用于依赖项(即其他标题)和编译器选项的插件供sourceCpp()使用。

包可以使用LinkingTo:，对于C++11指令，也可以使用src/Makevars或SystemRequirements。请参阅写R扩展，哪个文档记录了这个。