Snakemake + tmux

Question

我的工作流程通常包括向共享集群提交PBS作业，这些集群需要在调度队列中等待，运行时间超过24小时，或者两者兼而有之。我想在“后台”运行snakemake，并在这些作业运行时得到我的提示。我知道这可以使用tmux、screen或&来完成，但是有更好的方法吗？

我想提交一个包含snakemake命令的bash包装脚本是一种选择，但我认为我对工作流缺乏一些了解。

Answer 1

tmux是执行Snakemake工作流的推荐方法。它将为您提供所需的一切，无论您是在集群中还是在计算机服务器上。