docopt布尔arg python

Question

我在doctopt脚本中使用了下面的args

Usage:
GaussianMixture.py --snpList=File --callingRAC=File

Options:
-h --help     Show help.
snpList     list snp txt
callingRAC      results snp

我想添加一个对我的脚本有条件结果的参数:更正我的数据或者不更正我的数据。类似于：

Usage:
GaussianMixture.py --snpList=File --callingRAC=File  correction(--0 | --1)

Options:
-h --help     Show help.
snpList     list snp txt
callingRAC      results snp
correction      0 : without correction | 1 : with correction 

我想在我的脚本中添加一些函数中的if

def func1():
  if args[correction] == 0:
      datas = non_corrected_datas
  if args[correction] == 1:
      datas = corrected_datas

但我不知道如何在用法中写它，我的脚本也不知道。

Answer 1

编辑:我最初的答案没有考虑OP的要求-修正是强制性的。语法在我最初的回答中是不正确的。下面是一个经过测试的工作示例：

#!/usr/bin/env python
"""Usage:
    GaussianMixture.py --snpList=File --callingRAC=File --correction=<BOOL>

Options:
    -h, --help          Show this message and exit.
    -V, --version       Show the version and exit
    --snpList         list snp txt
    --callingRAC      results snp
    --correction=BOOL Perform correction?  True or False.  [default: True]

"""

__version__ = '0.0.1'

from docopt import docopt

def main(args):
    args = docopt(__doc__, version=__version__)
    print(args)

    if args['--correction'] == 'True':
        print("True")
    else:
        print("False")

if __name__ == '__main__':
    args = docopt(__doc__, version=__version__)
    main(args)

如果这对你有用，请告诉我。

Answer 2

并非所有选项都必须在docopt中有参数。换句话说，您可以使用标志参数代替。这是从用户获取布尔值的最直接的方法。尽管如此，你可以简单地做以下几件事。

"""
Usage:
  GaussianMixture.py (--correction | --no-correction)

Options:
  --correction      With correction
  --no-correction   Without correction
  -h --help     Show help.
"""
import docopt


if __name__ == '__main__':
    args = docopt.docopt(__doc__)
    print(args)