openCPU和rstan -无法打开连接

Question

我正在使用openCPU创建一个API来估计rstan中相当基本的模型。

我已经验证，当从正常的R控制台会话调用时，我的函数在我的环境中工作，而不是从openCPU调用。

但是通过openCPU调用时，响应如下：

cannot open the connection

In call:
file(con, "r")

通过在rstan源中插入检查点，我跟踪到R/cxxfunplus.R (链接到github上的行)中的一个调用：

dso <- new('cxxdso', sig = sig, dso_saved = save_dso, 
             dso_filename = dso_filename, 
             modulename = module_name, 
             system = R.version$system, 
             cxxflags = get_makefile_flags("CXXFLAGS"), 
             .CXXDSOMISC = new.env(parent = emptyenv()))

在这个调用中，什么是试图读取可能失败的连接？

Answer 1

发现了这一点-- rstan::get_makefile_txt正在寻找的两个makefile中的一个在openCPU下运行时并不存在。文件是/usr/share/R/share/make。

幸运的是，第一个makefile确实存在，并且已经足够了，因此可以通过跳过第二个makefile并只读取第一个来纠正这一点。

在rstan::get_makefile_text的最后一行之前，我插入了以下内容：

makefiles <- makefiles[file.exists(makefiles)]