OS中带有openmp的Python扩展

Question

我创建了一个python扩展，它在Linux中正常工作，但在os x中不工作。

C代码使用openmp库。

在os x中预装的C编译器是clang，预安装的python是用clang构建的。那种嘎嘎声不支持开胃。

通过安装gcc-6，我可以编译和运行代码：

    brew install gcc

我可以通过在文件setup.py中包含环境变量CC来构建我的libary：

    os.environ["CC"]="/usr/local/Cellar/gcc/6.2.0/bin/gcc-6"

我在设置配置中包括gcc库路径：

    library_dirs = ["/usr/local/Cellar/gcc/6.2.0/lib/gcc/6/","../build/"],

但是，当我从python加载库时，我获得了错误：

    import myLibraryName

dlopen(/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/LIBIRWLS.so，2)：符号未找到：___emutls_get_address引用自:/usr/local/___emutls_get_address/gcc/lib/6/libgomp.1.dylib预期在: /usr/lib/libSystem.B.dylib中/usr/local/opt/lib//6/libgomp.1.dylib。

我该怎么办？在OS中创建使用openmp库的python扩展的正确过程是什么？

Answer 1

我知道我已经解决了这个问题。这是我正在做的项目：

https://github.com/RobeDM/LIBIRWLS

简历：

1-我安装了gcc6

brew install gcc

2-然后我在文件setup.py中的环境变量中声明了gcc的路径：

os.environ["CC"]=/usr/local/Cellar/gcc/6.2.0/bin/gcc-6

3-我把CFLAGS环境变量空了：

os.environ["CFLGAS"]=""

4-在扩展模块中，我包含了与gcc6关联的文件libgomp.a，并使用了额外的ling arg“静态”：

ext_modules = [ 
    Extension('LIBIRWLS',
        include_dirs=['.','../include/',np.get_include()],
        sources = ['myexample.c'],
        extra_objects = ["/usr/local/Cellar/gcc/6.2.0/lib/gcc/6/libgomp.a",
            ....Object files of my library
        ],
        library_dirs = ["../build/"],
        extra_compile_args=['-Wno-cpp','-static','-lgomp','-lblas','-llapack'],
        extra_link_args=['-static']
    )
    ]

安装程序(名称= 'LIBNAME'，version = '1.0'，description=“”，install_requires= 'numpy'，'scipy'，url='https://myurl.com'，ext_modules = ext_modules )