提取社区节点和其他节点之间的边缘

Question

假设我们有一个简单的加权网络，在其上执行某种社区检测。接下来，我们提取特定的社区，最后的任务是提取该社区的所有节点与所有其他节点之间的所有边缘。

下面我粘贴了玩具代码。

# Create toy graph
library(igraph)
set.seed(12345)
g <- make_graph("Zachary")
# Add weights to edges
E(g)$weight <- sample(x = 1:10, size = ecount(g), replace = TRUE)
# Run community detection
cl <- cluster_louvain(g)

共有5个节点属于社区#1，12个节点属于社区#2等。

> table(membership(cl))
 1  2  3  4 
 5 12  2 15

现在我们提取社区#1

g1 <- induced_subgraph(g, which(cl$membership == 1))

问题：如何找到将社区#1中的节点与所有其他节点连接起来的边(不包括定义社区#1的边)？

Answer 1

从获取社区中的所有边缘开始：

all_edges <- E(g)[inc(V(g)[membership(cl) == 1])]
all_edges
+ 10/78 edges:
 [1] 1-- 5 1-- 6 1-- 7 1--11 5-- 7 5--11 6-- 7 6--11 6--17 7--17

然后，过滤掉完全是内部的(两个顶点都在社区中)：

all_edges_m <- get.edges(g, all_edges) #matrix representation

all_edges[!(
 all_edges_m[, 1] %in% V(g)[membership(cl) == 1] & 
   all_edges_m[, 2] %in% V(g)[membership(cl) == 1]
 )] # filter where in col1 and col2
+ 4/78 edges:
[1] 1-- 5 1-- 6 1-- 7 1--11