如何在Azure笔记本中使用r魔术？

Question

我正在尝试从R片段中获取一些数据到AzurePython3木星笔记本(http://notebooks.azure.com免费提供托管)。

我在Python3笔记本中尝试了以下操作：

%load_ext rmagic

然后尝试嵌入R：

%%R -o x
x <- 1

然后

x

这里我得到了Python：name 'x' is not defined -见下面的图片。在Python 3中嵌入R并使用Azure笔记本交换数据的正确方法是什么？

Azure笔记本http://nogin.info/R2Py.png

Answer 1

@DmitryNogin，我成功地复制了这个问题。根据这里下面的介绍，您现在需要在jupyter笔记本中使用%load_ext rpy2.ipython而不是%load_ext rmagic。

rmagic扩展已经移到rpy2作为rpy2.interactive.ipython。

然而，当我尝试笔记本中的%load_ext rpy2.ipython时，我发现了下面的一些错误。

ImportError: libRblas.so: cannot open shared object file: No such file or directory

我搜索了一个解决方案，它需要在Azure笔记本服务器上使用export LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib64/MR0-3.3.0/R-3.3.0/lib/R/lib (我通过命令which R找到的路径值)设置环境变量export LD_LIBRARY_PATH=/usr/lib64/MR0-3.3.0/R-3.3.0/lib/R/lib。但是，主机Ubuntu没有安装vi或vim，我也不知道终端中nbuser的sudo密码，所以虽然该解决方案适用于笔记本服务器终端的ipython，但无法使jupyter工作。

我最后的工作解决方案是使用笔记本服务器的终端命令ln -s /usr/lib64/MR0-3.3.0/R-3.3.0/lib/R/lib/* ~/anaconda3_410/lib/。

然后，当您输入%load_ext rpy2.ipython时，您将得到一个错误ImportError ..../libreadline.so.6: undefined symbol: PC。您只需要输入import readline就可以在%load_ext rpy2.ipython之前解决它。

最后，您可以使用一些警告信息加载rpy2.ipython用于%R xxx。

​

​

希望能帮上忙。