如何使用nco或cdo在netcdf文件中找到第一个正项的时间/日期？

Question

我有一个值的时间序列，当数据序列变为正值时，我希望找到第一个时间步骤的时间或日期。我知道我可以把它读入python、R或Fortran脚本来完成它，但是我想知道我是否可以从BASH中的命令行(也许使用nco或cdo )来完成它呢？

我想用

cdo gec,0.0 in.nc out.nc

做个面具但这对我没多大帮助。我需要根据数据的符号来分割文件，然后我可以简单地使用

cdo showdate 

用管状音箱发出声音。

这里有一个指向一个小示例文件的链接：

nc2.nc

有小费吗？

Answer 1

编辑答复：

通过添加到CDOv1.8.0继续(https://code.zmaw.de/projects/cdo/embedded/index.html#x1-3300002.8.1)中的新的计时器和函数，这个任务现在可以在网格字段中完成：

cdo gec,0 precip.nc mask.nc      # positive entries are 1, negative are zero
cdo timcumsum mask.nc maskcum.nc # sum the mask in the time direction

# invert the mask so that you have 1 at start, but then zero from 1st +ve val
cdo lec,0.5 maskcum.nc maskinv.nc   

# sum this new mask, and add 1, result is timestep when first positive value occurs:
cdo addc,1  -timcumsum maskinc.nc stepfirstpos.nc 

我认为这个函数可以在一条线上完成

cdo addc,1 -timcumsum -lec,0.5 -timcumsum -gec,0 precip.nc stepfirstpos.nc

原来的答案：

这花了我一年的时间，但我想出了一种方法，将NCO和CDO结合起来处理一个点文件，而不是一个网格化的字段：

#!/bin/bash
# code to find date of first positive file entry
file=trmm_per10_pc0_year2000_nc2.nc
# set negative values to missing
cdo -s setrtomiss,-1.e36,0.0 $file set.nc
ntime=`cdo -s ntime set.nc`  # number of steps in file
# loop over steps to find first positive value
for i in `seq 1 ${ntime}` ; do
  # nco counts from step 0, cdo from 1 
  ncoi=`expr $i - 1` 
  # print out the value in step i
  op=`ncks -d time,$ncoi -s "%16.10f\n" -H -C -v precip set.nc`
  if [[ $op != "_" ]] ; then  # not missing
    # print the date of timestep i
    cdo -s showdate -seltimestep,$i set.nc
    rm -f set.nc 
    exit
  fi
done
# no positive value found
rm -f set.nc
echo "All values in $file are negative"

Answer 2

我绞尽脑汁，想不出任何银弹。我为ncap2提供了以下代码片段。(在ncap2中循环未被优化)要运行代码段，请使用以下命令

ncap2 -v -O -S sign.nco  trmm_per10_pc0_year2000_nc2.nc foo.nc out.nc

/****************** sign.nco***********************************/
lon_sz=$lon.size;
lat_sz=$lat.size;
time_sz=$time.size;
*precip_prev=precip(0,0,0);
*precip_cur=2.0;
for(*idx=0;idx<time_sz;idx++)
{
   for(*jdx=0;jdx<lat_sz;jdx++)
   {

     for(*kdx=0;kdx<lon_sz;kdx++)
     {
      precip_cur= precip(idx,jdx,kdx);
      if( precip_cur > 0.0 && precip_prev<0.0)
         print(time(idx));

         precip_prev=precip_cur;

    }
  }
}
/***************************************************************/