R_LIBS_USER路径之争

Question

当我检查R环境时，我得到：

> Sys.getenv("R_LIBS_USER")
[1] "~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.3"

但是，当我cd到目录时，似乎根本没有这条路径：

dz33@ccis4240:~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library$ ll -a
total 12
drwxr-xr-x  3 dz33 dz33 4096 Jul  2  2015 .
drwxr-xr-x  3 dz33 dz33 4096 Jul 10  2015 ..
drwxr-xr-x 64 dz33 dz33 4096 Mar 30 16:41 3.2

如您所见，只有/3.2目录，只有/3.3目录。有人知道为什么以及如何更改为3.2或设置3.3吗？看来我的R版是最新的：

> R.Version()
$platform
[1] "x86_64-pc-linux-gnu"

$arch
[1] "x86_64"

$os
[1] "linux-gnu"

$system
[1] "x86_64, linux-gnu"

$status
[1] ""

$major
[1] "3"

$minor
[1] "3.0"

$year
[1] "2016"

$month
[1] "05"

$day
[1] "03"

$`svn rev`
[1] "70573"

$language
[1] "R"

$version.string
[1] "R version 3.3.0 (2016-05-03)"

$nickname
[1] "Supposedly Educational"

Answer 1

R_LIBS_USER变量是可选的，如果设置好了，则将添加到库路径(由.libPaths()显示)。

我可能是少数人，但在我负责的系统中，我试图取消设置R_LIBS_USER，这样我就可以

R> .libPaths()
[1] "/usr/local/lib/R/site-library" "/usr/lib/R/site-library"  
[3] "/usr/lib/R/library"           
R> 

这意味着install.packages()等人将使用一个系统范围的目录，供系统上的所有用户访问--这在我们有多用户系统的工作中是有意义的。需要注意的一点是，您希望您的用户是在该目录上具有组写权限的组的成员，以便能够安装(只要您可以信任您的用户)。

这样做也消除了您所观察到的版本目录(即3.2/和3.3/)。

更详细的细节在help(Startup)上。