用外部C库在Rcpp中编译C++

Question

我试图用Rcpp代码构建一个使用外部库的R包。我以前曾问过如何在包这里中使用外部C库。我所面临的问题是，只要我包括以下代码行

y = N_VNew_Serial(3);

我收到错误了

sundials_test.o:sundials_test.cpp:(.text+0x2ba): undefined reference to `N_VNew_Serial'
collect2: ld returned 1 exit status
Error in Rcpp::sourceCpp("src/sundials_test.cpp") : 
  Error occurred building shared library

我没有发现这行的错误

N_Vector y = NULL;

所以，我觉得和图书馆的连接很正常。我还确认了N_VNewSerial()的函数声明在nvector/nvector_serial.h中，以防您需要查看整个包代码，它是可用的这里。

特定Rcpp文件的代码粘贴在下面

#include <Rcpp.h>

// #include <iostream.h>
#include <cvode/cvode.h>               /* prototypes for CVODE fcts., consts. */
#include <nvector/nvector_serial.h>    /* serial N_Vector types, fcts., macros */
#include <cvode/cvode_dense.h>         /* prototype for CVDense */
#include <sundials/sundials_dense.h>   /* definitions DlsMat DENSE_ELEM */
#include <sundials/sundials_types.h>   /* definition of type realtype */

using namespace Rcpp;

void InitialConditions (NumericVector x){

  N_Vector y = NULL;
  // y = N_VNew_Serial(3);
  //
  // NV_Ith_S(y,0) = 1;
  // NV_Ith_S(y,1) = 2;
  // NV_Ith_S(y,2) = 3;


}

我不知道为什么代码要将undefined reference报告给一个函数，而不是报告到同一个头文件中的另一个函数，如果能帮助理解这个错误，我们将不胜感激。

谢谢!

SN248

Answer 1

这是一个链接错误，而不是编译错误。编译成功，让您进入链接步骤。但

sundials_test.o:sundials_test.cpp:(.text+0x2ba): \
  undefined reference to `N_VNew_Serial'
collect2: ld returned 1 exit status
Error in Rcpp::sourceCpp("src/sundials_test.cpp") : 
  Error occurred building shared library

非常清楚:r不能构建共享库，因为您没有链接到提供它的对象代码(我想是Sundials )。