问图中不同部分的颜色可视化
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Stack Overflow用户

提问于 2016-06-08 17:01:16

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我有一些基因表达数据在不同部位的植物根(见图)，我想显示基因表达水平在不同部位的根。例如，如果基因在顶端分生组织中高表达，我想在示意图中标记顶端分生组织部分红色。一种可能是把这张图变成一张地图，有没有人建议如何在R中绘制一张地图呢？或者如果你知道这方面的任何工具，请告诉我。谢谢!

植物根系结构

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发布于 2016-06-08 18:08:20

您可以使用套餐绘制自己的多边形来分隔区域。或者，这个职位可能提供了一种更好的方法来实现这一点。

然后，你可以创建一个热图和颜色内的多边形。比如说，用ggplot2::geom_polygon()

为了使它看起来更好，您可以使用原始图像作为背景，然后用一些透明度(即alpha参数在ggplot2中)覆盖您的热图，这样您就可以看到彩色热图和一些原始图像。有关更多详细信息，请参见这个职位，如果您喜欢有趣的图片，请参阅这个职位

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/37708661

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