使用R包brms时出错

Question

我想使用R包brms，但我得到一个错误，我没有设法解释。它可能与Rtools有关，但是它安装在我的计算机上。

这是brms包中的一个示例：

 fit1 <- brm(count ~ log_Age_c + log_Base4_c * Trt_c 
        + (1|patient) + (1|visit) + (1|obs), 
        data = epilepsy, family = poisson(), 
        prior = c(set_prior("student_t(5,0,10)", class = "b"),
                  set_prior("cauchy(0,2)", class = "sd")))

这就是我遇到的错误：

compileCode中的错误(f，code，language = language，verbose = verbose)： 编译错误，函数/method(S)未创建！ c:/Rtools/mingw_64/bin/g++：找不到 制造：* file202834c75e9.o错误127 警告信息： C:/PROGRA~1/R/R33~1.0/etc/x64/Makeconf“"C:/PROGRA~1/R/R-33~1.0/share/make/winshlib.mk”SHLIB_LDFLAGS='$(SHLIB_CXXLDFLAGS)‘SHLIB_LD='$(SHLIB_CXXLD)’SHLIB=“文件202834c75e9.dll”WIN=64 TCLBIN=64 OBJECTS=“file202834c75e9.o”renvoie 2“ 此外:警告信息： 运行命令C:/PROGRA~1/R/R-33~1.0/bin/x64/R文件202834c75e9 CMD 2> file202834c75e9.cpp.err.txt‘具有状态1

谢谢你的帮忙

Answer 1

事实上，这是Rtools的一个问题。system("g++ -v")给你什么？如果是状态127，则R很可能找不到Rtools，在Rtools安装过程中，您还没有选中该框，在该框中，您被要求修改系统路径。我建议您重新安装所有的Rtools，并确保选中该框。还请验证您是否使用了与R版本兼容的正确版本的Rtools。

Answer 2

我在安装rstan时也遇到了类似的问题。这个问题发生在RTools33上。安装RTools34似乎解决了这个问题，尽管我现在收到了以下警告：

In find_rtools() :

  WARNING: Rtools 3.4 found on the path at c:/Rtools is not compatible with R 3.3.1.

Please download and install Rtools 3.3 from http://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/, remove the incompatible version from your PATH, then run find_rtools().

到目前为止，这一警告似乎是良性的。

Answer 3

如果没有其他答案解决这个问题，请进入R发行版并打开

R-{version}\etc\x64\Makeconf

并将第19行的BINPREF更改为指向mingw_64\bin目录的任何路径。