熊猫HDFStore怪异的行为

Question

我对此感到非常困惑，我有两个脚本运行在同一个笔记本服务器上。我在同一个文件夹中有一个HDFStore，但是对于一个脚本，它看起来是空的，而另一个则没有。

import os 
os.getcwd()

返回NB 1：‘e：\DoingDataScience\标识\脚本’

返回NB 2：‘e：\DoingDataScience\标识\脚本’

store = pd.HDFStore('data_test.h5')
store.items

返回NB 1：

<bound method HDFStore.items of <class 'pandas.io.pytables.HDFStore'>
File path: data_test.h5
/test_database            frame        (shape->[3,5])>

返回NB 2：

<bound method HDFStore.items of <class 'pandas.io.pytables.HDFStore'>
File path: data_test.h5
Empty>

所有的情况都是一样的。它跟踪潘达斯DF的来源吗？我想可能是因为NB 1已经打开了这个文件，因为NB 1创建了它。然而，杀死NB 1和重新启动NB 2也没有任何作用。

编辑:添加os.stats：

NB 1和NB 2均：

nt.stat_result(st_mode=33206, st_ino=0L, st_dev=0L, st_nlink=0, 
st_uid=0, st_gid=0, st_size=1311400L, st_atime=1465072325L, 
st_mtime=1465149771L, st_ctime=1465072325L)

更新:现在，在重新启动之后，我得到了一个新错误：

HDF5ExtError: HDF5错误返回跟踪

文件"C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5F.c"，第604行，在无法打开文件文件的"C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5Fint.c"，第1085行中，在H5F_open中无法读取超级块文件"C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5Fsuper.c"，第294行，在无法加载超级块文件"C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5AC.c"，第1320行的H5F_super_read中，H5AC_protect H5C_protect()失败。文件“C：\aroot\work\hdf5 5-1.8.15-patch1 1\src\H5C.c”，第3574行，在H5C_protect中无法加载条目文件"C:\aroot\work\hdf5-1.8.15-patch1\src\H5C.c"，第7954行，无法加载输入文件的H5C_load_entry第476行，在H5F_sblock_load截断文件中:H5C_load_entry= 800，sblock->base_addr = 0，stored_eoa = 1181448

HDF5错误返回跟踪的结束

无法打开/创建文件“data_test.h5”

Answer 1

很可能你已经写了你的数据

/test_database            frame        (shape->[3,5])>

在nb1的会话中，并且没有关闭store (这会将您的更改保存并刷新到文件/磁盘)。

因此，当您在h5中打开NB2文件时，它还没有刷新，因此是空的。