XMLstarlet和R

Question

我一直试图在R中使用xmstarlet，而不是在bash中运行我的xmlstarlet脚本，然后将其输送到R，但我尝试过的一切都没有奏效。我甚至不确定这是否可能。

我试过这个：

shell(cmd=(xmlstarlet sel -t -c "someinput"), intern=TRUE)

仅bash中的命令就能工作，但是当我尝试这样做时，我会得到以下错误：

Error: unexpected symbol in "shell(cmd=(xmlstarlet sel"

我不太确定是否应该使用system()而不是shell。我也用过系统，但没有成功

编辑：

完整的命令示例，也可以找到带有完整xml文件的here。

xmlstarlet sel -t -m "/bookstore/book/Description" -i "@stock='YES'" -v '/bookstore/book/Location/shelf'

Answer 1

将命令保存为字符向量，并使用system

cmd <- "xml el http://stackoverflow.com"
system(command = cmd, intern = T)

这给了我

http://stackoverflow.com:12.163: EntityRef: expecting ';'
/cdn.sstatic.net/Sites/stackoverflow/img/apple-touch-icon@2.png?v=73d79a89bded&a
                                                                               ^
[1] "html"                          "html/head"                     "html/head/title"              
[4] "html/head/link"                "html/head/link/link"           "html/head/link/link/link"     
[7] "html/head/link/link/link/meta"
attr(,"status")
[1] 4

如果在xmlstarlet命令中使用双引号，则必须使用反斜杠将它们转义。使用添加到问题中的示例：

cmd <- "xmlstarlet sel -t -m \"bookstore/book\" -i \"Description/stock='YES'\" -v \"Location/shelf\" -n /PATH/TO/books.xml"
system(command = cmd, intern=T)

输出：

[1] "30" "21" "11"