为在同一扫描会话中获取的两个MR数据集寻找相同切片位置的坐标(mm)

Question

我有两个MR获取，第一个是三维获取(1x1x1 mm3)，第二个是2D获取(2.24x2.24x5.00mm，轴向切片)。高分辨率数据集是一个完整的头部三维采集，如果在轴向重新划分的话，就会得到176张切片(在获取过程中，方位最初是下降的)。二维获取只包含三个轴向脑片，这些脑片被选择来定位大脑中的特定区域，并被连续获取。

是否有可能知道，在三维高分辨率数据集中，哪些切片与2D数据集中的3个切片准确地对应，假设被测对象没有在扫描之间移动，并且这些数据集是在同一扫描会话中获得的？我正在查看这两个数据集的字典，并试图使用ImageOrientationPatient和ImagePositionPatient标记来准确地找出二维扫描中的切片相对于磁铁的等中心的坐标。这样，我就可以知道2D采集中的第一个切片相对于磁铁的等中心的精确坐标，假设两次扫描有相同的起源，那么我就能准确地知道在三维扫描中哪个轴向切片的坐标对应于哪个？我所面临的问题是，ImageOrientationPatient向量对于两种获取都是不同的，因为高分辨率是通过矢状方向的指定获得的(虽然是3d的，并且可以获得任意方向的切片)，而二维数据是以轴向切片的形式专门获取的。

一个有dicom操作经验的人能给我一些关于我如何连接这两次扫描的了解吗？因为它是相同的扫描会议，我假设这两个收购的参考位置应该是相同的。对吗？

Answer 1

只有当所有图像都是在一次扫描中拍摄时，ImagePositionPatient才能可靠地引用相同的坐标系。不幸的是，没有“对病人的校准”，以确保一个特定的坐标总是引用相同的位置在同一个病人。

假设扫描是这样的，任务非常简单。每一次扫描的完整几何学定义如下：

• ImagePositionPatient (0020,0032) -每个切片左上角像素的坐标
• ImageOrientationPatient (0020,0037) -每个切片的方向向量，即像素行和列对齐的轴。
• PixelSpacing (0028,0030) -高度和宽度(是的，y维在这里第一！)每个像素

现在您已经精确地知道了两个扫描中每个切片的每个像素的位置，剩下的任务是在3D扫描的维度中表示2D扫描的左上角像素。我会使用坐标转换来实现这一点，但其他方法也会起作用。