最佳实践在生产包版本中运行的R脚本

Question

我们有一个linux (Ubuntu14.10)生产服务器，我们已经编写了许多我们想要在其上运行的R脚本，这些脚本将从API或web抓取中收集数据。然后，数据将被写入CSV文件。

我的背景是Server/Fortran，在生产环境方面应该遵循非常具体的最佳实践。一些突出的问题是：-

• 生产环境在版本控制方面应该是稳定的，无论是从代码的角度来看，还是在安装的应用程序、操作系统等方面。
• 对代码/应用程序/操作系统的更改应该在一个单独的环境中进行，或者以一种可以控制和可以倒置的方式进行。如果存在第二个环境，则可以执行并行执行测试系统更改的可能性。
• (很大程度上)，开发人员不能改变生产环境。

我的问题是：如何确保与我的R代码关联的包保持一致和不变，直到我选择更新它们？

Answer 1

您可以使用Docker；我们的摇杆工程有几个合适的容器可以启动。

否则，只需使用基本Unix sys.admining：

• 如果您不想更改R的包目录，请使它们只读
• 使用HPC人员的一些技巧，并使用“模块”(即符号链接或路径设置的层)使某些路径和目录可见或不可见

一般来说，可复制性研究的任务观还有一些进一步的指针。您可以在每次生产运行中记录所使用的版本，还可以设置运行方式，以便将版本与预期版本进行比较。

但所有这些都不是真正的R --这些都是部署的“元”问题。