rpy2的Anaconda导入错误

Question

在Anaconda上使用rpy2有问题。问题是，由于以下TypeError，它无法导入：

TypeError:类型'rpy2.rinterface.StrSexpVector‘是不可接受的基类型

我的python版本是3.5，我的anaconda版本是4.0.0，我的rpy2版本是2.7.0。

问题似乎是，Anaconda现在使用的版本3.5与rpy2 2.7.3或更低版本不兼容，请参见https://bitbucket.org/rpy2/rpy2/issues/313/typeerror-type-rpy2rinterfacestrsexpvector --因为Anaconda目前默认安装2.7.0，导入失败。如何解决这个问题呢？

这个问题与这里询问的问题Error when loading rpy2 with anaconda相似，但是，安装2.7.0的旧解决方案不再像上面解释的那样兼容。

Answer 1

如果您碰巧在OS上，我已经为rpy2 2.8.0构建了Conda软件包，您可以使用：

conda install -c ijstokes rpy2=2.8.0

它们可用于Python2.7和3.5。这个问题源于现在已经修复的rpy2 bug：https://bitbucket.org/rpy2/rpy2/issues/313/typeerror-type-rpy2rinterfacestrsexpvector。

如果您不在OS上，那么您可以使用以下内容构建自己的版本：

conda skeleton pypi rpy2 --version=2.8.0 --python=3.5
conda build rpy2
conda install --use-local rpy2

这些命令来自内存，但它们应该工作或足够接近，您可以找到确切的选项。