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社区首页 >问答首页 >如何使用HDF5包对RHDF5文件中的数据集具有无限的维度?

如何使用HDF5包对RHDF5文件中的数据集具有无限的维度?
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Stack Overflow用户
提问于 2016-03-31 06:02:49
回答 1查看 207关注 0票数 0

虽然它可能看起来类似于一个已经存在的问题:is-it-possible-to-update-dataset-dimensions-in-hdf5-file-using-rhdf5-in-r,但它们并不完全相同。

在RHDF5文档中,我们可以定义数据集在使用h5createDataset() (使用maxdims参数)创建数据集时可以具有的最大维度。但是,如果我们事先不知道数据集的维数,例如,我们可能会遇到数据集的大小不断增大的情况,因此,我们不知道数据集可以达到的最大维数。

在对上述问题的回答中,提到可以借助dataspace和HDF5常量来完成。

有谁能提供一些关于如何使用HDF5常量和数据空间来做到这一点的想法呢?

EN

回答 1

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2016-04-10 06:26:39

在对函数h5createDataset()进行一些实验时,我找到了一种方法:

代码语言:javascript
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> library(rhdf5)

> fid <- H5Fcreate('test.h5')

> h5createGroup(fid,'1')
[1] TRUE

> h5createDataset(fid,'1/1',dims = c(2,2,2),maxdims = c(Inf,Inf,Inf))
[1] TRUE
Warning message:
  In H5Screate_simple(dims, maxdims) :
  NAs introduced by coercion to integer range

> arr <- array(c(1:8),c(2,2,2))

> h5write(arr,fid,'1/1')

> h5read(fid,'1/1')
, , 1

     [,1] [,2]
[1,]    1    3
[2,]    2    4

, , 2

     [,1] [,2]
[1,]    5    7
[2,]    6    8

如果我错了,或者有更好的方法,请纠正我。

票数 1
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页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/36325350

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