rmarkdown:如何为文档使用多个书目

Question

我的环境: Win 7 Pro /R 3.2.1 / knitr_1.12.3 /R Studio版本0.99.892

我试图用section编写一篇.Rmd格式的文章，编制-> PDF，我一直在跟踪citations.html，了解如何让pandoc和pandoc-citeproc在文本中生成参考部分和引文。

我的BibTeX引用在几个不同的.bib文件中，当在.Rnw文件中使用LaTeX时，所有这些引用都可以通过(本地文本My树)找到。

\bibliography{statistics, graphics}

我似乎无法用pandoc-citeproc来完成这个任务。我的YAML头具有以下内容，它适用于one .bib文件，只要它与源.Rmd文件位于同一个目录中：

    ---
    title: "Notes on Testing Equality of Covariance Matrices"
    author: "Michael Friendly"
    date: '`r format(Sys.time(), "%B %d, %Y")`'
    output:
      pdf_document:
        fig_caption: yes
        keep_tex: yes
        number_sections: yes
    csl: apa.csl
    bibliography: statistics.bib
    ---

根据上面给出的链接中的建议，我尝试：

bibliography: [statistics.bib,graphics.bib]

这意味着：

pandoc-citeproc.exe: "stdin" (line 50, column 12):
unexpected ":"
expecting letter, digit, white space or "="
pandoc.exe: Error running filter pandoc-citeproc
Filter returned error status 1

编辑:为了完整起见，我展示了生成的pandoc命令，其中看起来两个.bib文件都被正确传递了。

"C:/Program Files/RStudio/bin/pandoc/pandoc" +RTS -K512m -RTS EqCov.utf8.md --to latex --from markdown+autolink_bare_uris+ascii_identifiers+tex_math_single_backslash --output EqCov.pdf --template "C:\R\R-3.2.1\library\rmarkdown\rmd\latex\default-1.15.2.tex" --number-sections --highlight-style tango --latex-engine pdflatex --variable graphics=yes --variable "geometry:margin=1in" --bibliography statistics.bib --bibliography graphics.bib --filter pandoc-citeproc 
output file: EqCov.knit.md

所有下列表格也是如此：

    bibliography: ["statistics.bib","graphics.bib"]

    bibliography: 
      - "statistics.bib"
      - "graphics.bib"

    bibliography: 
      - statistics.bib
      - graphics.bib

理想情况下，我希望能够使用以下表单之一，而不必将.bib文件复制到文档目录。

bibliography: ["C:/Dropbox/localtexmf/bibtex/bib/statistics.bib","C:/Dropbox/localtexmf/bibtex/bib/graphics.bib"]

bibliography: 
 - "C:/Dropbox/localtexmf/bibtex/bib/statistics.bib"
 - "C:/Dropbox/localtexmf/bibtex/bib/graphics.bib"

Answer 1

为了记录在案:我在https://github.com/jgm/pandoc-citeproc/issues/220上向pandoc提出了这个问题。

事实证明，在pandoc-citeproc如何处理@{string={}}中的某些字符和.bib文件中的非ASCII字符方面存在问题，所以我现在尝试的是使用硬编码的路径名，以我尝试过的所有形式工作。

为了使它更像通过Latex/bibtex处理.Rnw文件，能够使用类似于

bibliography: 
  - `r system(kpsewhich statistics.bib)`
  - `r system(kpsewhich graphics.bib)`

这些命令确实会在R会话中找到正确的文件，但不会从YAML头找到正确的文件。