使用mongolite R软件包将json对象插入MongoDB

Question

在R中有很多处理MongoDB的包，我开始使用'mongolite‘包，因为我使用'jsonlite’和'mongolite‘构建在'jsonlite’之上。但是，我有点困惑，为什么'mongolite‘中的插入函数不允许插入json对象(help说它插入数据格式)？

我应该使用哪个包来存储json对象并执行简单的查询？

Answer 1

如果使用jsonlite，仍然可以使用mongolite插入数据，但是只有当也可以强制使用data.frame (使用fromJSON)时，才能使用。例如：

js <- '[
  {
    "id": 1,
    "val": "a"
  },
  {
    "id": 2,
    "val": "b"
  },
  {
    "id": 3,
    "val": "c"
  }
] '


library(jsonlite)
library(mongolite)

mongo <- mongo(collection = "test", db = "test", url = "mongodb://localhost",
      verbose = TRUE)

mongo$insert(fromJSON(js))
# Complete! Processed total of 3 rows.
# [1] TRUE

但是，我的理解是，mongolite包将只插入data.frames。例如，采用一个更复杂的JSON结构，您将看到我们不能使用mongolite插入它

js <- '{"foo":[{"id":1,"val":"a"},{"id":2,"val":"b"},{"id":3,"val":"c"}],"bar":[[{"id":1,"val":"a"},{"id":2,"val":"b"},{"id":3,"val":"c"}]]}'

## if we try to insert this using mongolite we get an error
## because it is not a data.frame
> mongo$insert(fromJSON(js))
Error: is.data.frame(data) is not TRUE

要插入更复杂的JSON结构，我们可以使用rmongodb包中的mongo.bson.from.json函数

library(rmongodb)
mongo <- mongo.create()
mongo.is.connected(mongo)
# [1] TRUE

db <- "test"
coll <- "test"

bs <- mongo.bson.from.JSON(js)

mongo.insert(mongo, ns = paste0(db ,".", coll), b = bs)
# [1] TRUE

注意到mongodb实际上存储了BSON

MongoDB在幕后以二进制编码格式BSON表示JSON文档。BSON扩展了JSON模型，以提供额外的数据类型，并在不同语言中高效地编码和解码

参考资料：JSON和BSON

Answer 2

开发版本的mongolite现在支持直接插入嵌套列表或json，请参阅https://github.com/jeroenooms/mongolite/issues/42。

您还可以使用m$iterate()或m$iterate()$batch()查询并取回嵌套列表。