get中的包错误(“rgeos”，envir = .MAPTOOLS_CACHE)：找不到对象'rgeos‘

Question

我对R和它的包系统都很陌生，我刚刚编写了我的第一个包，目的是将它与OpenCPU一起使用。

在执行此功能时：

#' Create a PNG which shows interpolated senseMap Data
#' 
#' @export
#' @import jsonlite
#' @import sp
#' @import gstat
#' @import rgeos
#' @import maptools
#' @param JSON

inteRidwTest <- function(input){
  ### JSON to data.frame ###
  oSeM_df <- input
  ### data.frame to spatialPointsDataFrame ###
  coordinates(oSeM_df) =~longitude+latitude
  ### adding CRS to the data ###
  proj4string(oSeM_df)="+proj=longlat +datum=WGS84"
  project_df=spTransform(oSeM_df, CRS("+proj=longlat +datum=WGS84")) 
  ### creating a bounding box ###
  bbox <- bbox(oSeM_df)
  ### creating a grid based on the bbox ###
  x.range <- as.numeric(c(floor(bbox[1]), ceiling(bbox[3]))) # min/max longitude of the interpolation area
  y.range <- as.numeric(c(floor(bbox[2]), ceiling(bbox[4])))# min/max latitude of the interpolation area  
  grd <- expand.grid(x = seq(from = x.range[1], to = x.range[2], by = 0.1), y = seq(from = y.range[1], to = y.range[2], by = 0.1))
  coordinates(grd) <- ~x + y
  gridded(grd) <- TRUE
  grdSp <- as(grd, "SpatialPolygons")
  ### adding CRS to grid ###
  proj4string(grdSp)="+proj=longlat +datum=WGS84"
  grd_df=spTransform(grdSp, CRS("+proj=longlat +datum=WGS84")) 
  ### setting up basegrid for the png ###
  grdSp.union <- unionSpatialPolygons(grd_df, rep("x", length(slot(grd_df,"polygons"))))
  llGRD <- GE_SpatialGrid(grdSp.union)
  llGRD_in <- over(llGRD$SG, grdSp.union)
  llSGDF <- SpatialGridDataFrame(grid = slot(llGRD$SG,"grid"), proj4string = CRS(proj4string(llGRD$SG)), data = data.frame(in0 = llGRD_in))
  llSPix <- as(llSGDF, "SpatialPixelsDataFrame")
  ### IDW ###
  llSPix$pred <- idw(value ~ 1, oSeM_df, llSPix)$var1.pred
  return(llSPix$pred)
#   ### create the png ###
#   png(file = "idw.png", width = llGRD$width,height = llGRD$height, bg = "transparent")
#   par(mar = c(0, 0, 0, 0), xaxs = "i", yaxs = "i")
#   image(llSPix, "pred", col = bpy.colors(20, alpha=0.7))
#   dev.off()
}

使用此输入：https://gist.githubusercontent.com/mdragunski/643a8557a4a0e37d30a1/raw/02d26c3ce83ee0c0c704b7c53984c640002c331f/oSeM-Data-processed.json

引发以下错误：

未找到OpenCPU error HTTP400对象“rgeos” In call: get("rgeos"，envir = .MAPTOOLS_CACHE)

在尝试在本地使用此包和函数时，也会引发相同的错误。如果在我的inteRsense包之前安装并添加了rgeos包，它将按预期工作。

错误似乎连接到我的包导入的rgeos和maptools包，我想在使用我的包时更改这些包的导入顺序。但我不知道如何在命名空间文件中这样做：

# Generated by roxygen2: do not edit by hand

export(helloWorld)
export(inteRidw)
export(inteRidwTest)
import(gstat)
import(jsonlite)
import(maptools)
import(rgeos)
import(sp)

因此，我想我这里的问题是:如何更改R包中的命名空间文件？但我真的很感激你的帮助。

Answer 1

如何更改R包中的命名空间文件？

若要更改R包中的命名空间文件，必须：

1. 从可用源(es )下载包源*.tar或*.zip。映射工具包链接)
2. 编辑命名空间文件并添加一行，说明要导入的包或函数/包
3. 编辑描述文件并将包添加到“依赖”或“导入”字段
4. 重新构建包

问题是，更改将是本地的，您必须自己分发修改后的包。

在这种情况下，最好的解决方案可能是与包的维护人员联系，看看它是否能够修复问题并更新cran存储库中的包。

然而，我正经历着同样的问题。我知道这个错误：

Error in get("rgeos", envir = .MAPTOOLS_CACHE) : object 'rgeos' not found

当我正在开发的包调用maptools函数‘unionSpatialPoly龙’时。我正在处理的包同时导入了maptools和rgeos包，但仍然失败。如果maptools包是由用户手动加载的，那么一切都可以正常工作。

因此，另一个临时解决方案是在加载包后加载maptools包。

更新

我编辑了我正在处理的包的描述文件。我将'maptools‘包从“导入”字段移到“依赖”字段，问题似乎就消失了！