使用ggplot2时stat_quantile的置信区间带？

Question

我想将中值样条和相应的置信区间带添加到ggplot2散点图中。我使用的是‘’quantreg‘-包裹，更具体地说是rqss函数(加法分位数回归平滑)。

在ggplot2中，我可以添加中间样条，但不能添加置信区间带：

fig = ggplot(dd, aes(y = MeanEst, x = N, colour = factor(polarization)))
fig + stat_quantile(quantiles=0.5, formula = y ~ qss(x), method = "rqss") +
  geom_point()

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quantreg-package附带了自己的绘图函数：plot.rqss。在这里，我可以添加置信区间(bands=TRUE)：

plot(1, type="n", xlab="", ylab="", xlim=c(2, 12), ylim=c(-3, 0)) # empty plot
plotfigs = function(df) {
  rqss_model = rqss(df$MeanEst ~ qss(df$N))
  plot(rqss_model, bands=TRUE, add=TRUE, rug=FALSE, jit=FALSE)
  return(NULL)
}
figures = lapply(split(dd, as.factor(dd$polarization)), plotfigs)

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然而，quantreg-package附带的绘图函数并不非常灵活/非常适合我的需要。是否有可能在ggplot2图中得到置信带？也许是模仿quantreg-package中使用的方法，还是简单地从绘图中复制它们？

资料来源：巴斯丁.

Answer 1

你差点就有了。当你打电话的时候

 plot(rqss_model, bands=TRUE, add=TRUE, rug=FALSE, jit=FALSE)

函数非常有用地返回绘制的数据。我们要做的就是抓取数据帧。首先，稍微调整一下函数，以合理的方式返回数据。

plotfigs = function(df) {
  rqss_model = rqss(df$MeanEst ~ qss(df$N))
  band = plot(rqss_model, bands=TRUE, add=TRUE, rug=FALSE, jit=FALSE)
  data.frame(x=band[[1]]$x, low=band[[1]]$blo, high=band[[1]]$bhi, 
             pol=unique(df$polarization))
}

下一次调用函数并压缩

figures = lapply(split(dd, as.factor(dd$polarization)), plotfigs)
bands = Reduce("rbind", figures)

然后使用geom_ribbon绘制

## We inherit y and color, so have to set them to NULL
fig + geom_ribbon(data=bands, 
                  aes(x=x, ymin=low, ymax=high, 
                  y=NULL, color=NULL, group=factor(pol)), 
                  alpha=0.3)