批量处理GC-MS数据

Question

这是我的问题。

• 我的实验室有一个GC-MS(气相色谱-质谱)设备，用于每小时检测挥发性有机化合物(VOCs)的浓度。
• 因此，随着时间的积累，我有那么多小时数据(.qgd格式)。采用预建法，包括近100种植物的面积、高度、Conc、Ret.time等.
• 我现在的目标是为每个文件剪辑每个物种的浓度(一年= 8760个文件)。这是一项相当繁重的工作。

是否有人对大量的实验数据有熟悉的经验，而这些数据只能由特定的软件打开？

有什么方法可以批量处理这些文件吗？

PS:我熟悉Python语言。如果它可以通过Python实现，那就太棒了！

Answer 1

根据特性概述，OPENChrom确实支持岛津以专有QGD格式导入文件。

如果这不能直接工作，您可以尝试使用供应商软件将原始数据导出为一些(更多的)文档格式，例如JCAMP DX、netCDF或mzML优先。