降级PDF引用没有正确渲染(csl问题？)

Question

我开始着手写出版物了。根本没有生成.html文件或.docx文件的问题，但是当我生成.pdf文件时，引用似乎并不继承.csl文件中定义的样式。

例如，我希望使用编号为.csl的样式：

[@Author_Title_2003] -> (1)

这在.html和.docx文件中是成功的，但在.pdfs中我得到：

[@Author_Title_2003] ->作者，2003年

也印上了方括号。

举个例子：

test.rmd：

---
title: 'My Title'
author: "Me me me me!"
output: pdf_document
bibliography: references.bib
csl: elsevier-vancouver.csl
---

Application written in the R programming language [@RCoreTeam] using the Shiny framework [@Chang2015].

# REFERENCES

references.bib：

@Misc{Chang2015,
  Title                    = {shiny: Web Application Framework for R. R package version 0.12.1},
  Author                   = {Chang, W. and Cheng, J. and Allaire, JJ. and Xie, Y. and McPherson, J. },
  Year                     = {2015},
  Type                     = {Computer Program},
  Url                      = {http://CRAN.R-project.org/package=shiny}
}
@Article{RCoreTeam,
  Title                    = {R: A Language and Environment for Statistical Computing},
  Author                   = {{R Core Team}},
  Year                     = {2015},
  Type                     = {Journal Article},
  Url                      = {http://www.R-project.org}
}

elsevier-vancouver.csl：链接

运行rmarkdown::render("test.Rmd", "pdf_document")提供：

/home/jordan/.cabal/bin/pandoc +RTS -K512m -RTS paper.utf8.md --to latex --from markdown+autolink_bare_uris+ascii_identifiers+tex_math_single_backslash-implicit_figures --output paper.tex --template /home/jordan/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/rmarkdown/rmd/latex/default-1.14.tex --highlight-style tango --latex-engine pdflatex --natbib --variable graphics=yes --variable 'geometry:margin=1in' --bibliography references.bib 

输出文件是：

​

​

请参阅格式错误的引文。还请注意，不管头中的csl参数如何，都会生成这种格式。任何帮助都将不胜感激。

pandoc版本1.15.2.1，版本0.8.1.3。

Answer 1

所以，我弄清楚了在阅读了rmarkdown的软件包代码之后发生了什么，以及( b)更好地了解了latex。我想我应该把我的答案张贴在这里，以防任何人有类似的问题。

简而言之，rmarkdown从.tex文件中生成一个.rmd文件，然后使用latexmk (或类似的R系统调用)处理.tex文件。当然，乳胶引擎实际上并不使用.csl样式的文件，而是bibtex使用.bst文件。

简而言之，对于.pdf文档中的格式化引用(从.rmd生成)，可以：

1. 创建一个具有所需格式的.bst文件，并手动转换R(Studio)生成的.tex文件。
2. 再次使用pandoc将.tex文件转换为pdf，这可以在过程中使用.csl文件。然而，这似乎确实消除了超链接。