C++ -损坏字符串

Question

我对C++非常陌生，但我习惯于使用R语言编写代码。几周前，我开始构建一个小应用程序，它应该复制和重命名文件对(..seq/.ab1)。DNA测序器分析的结果(手动重命名数百个将是一种实时的浪费，特别是因为我们有新名字的列表)。

一切似乎都很好，但是新文件(复制的文件)的名字中出现了一个“特殊字符”(就在文件类型之前)，它看起来像空格，但它不是(我用空格替换了它，文件正确打开)。删除该文件后，它的相关应用程序可以对其进行操作，但使用该应用程序，应用程序会增加要损坏的文件。

这个问题似乎来自于与ostringstream流：：str成员函数相关的代码，但老实说，我不知道如何修复它。在添加文件类型之前，我想知道它是否没有插入空字符.

这是代码中负责的部分。它从一个由";“分隔的2列csv文件中获取新旧名称。原始数据和新的(重命名的文件)数据保存在不同的目录中，这就是我需要在for循环中创建一个包含每个文件路径的字符串的原因。我打算稍后检查旧的和新的文件内容，可能使用memcmp。但首先，我需要正确地重新命名它们。

我在Ubuntu14.04 (64位)机器上，gcc 4.8.4作为编译器。我已经原谅自己的编程能力很差，英语也不太好，我不是以英语为母语的人(实际上是作家)。

    fNew.open(filename);
    std::ostringstream oldSeqName (std::ostringstream::ate);
    std::ostringstream newSeqName (std::ostringstream::ate);
    std::ostringstream oldAb1Name (std::ostringstream::ate);
    std::ostringstream newAb1Name (std::ostringstream::ate);

    std::fstream log;
    time_t now = time(0);

    for (std::string nOld, nNew; getline(fNew, nOld, ';') && getline(fNew, nNew); )
    {
        std::cout << "Old Name: " << nOld << " -> New Name: " << nNew << std::endl;

        // Keep a log of the name changes
        log.open("NameChangesLog.txt", std::fstream::out | std::fstream::app);
        log << ctime(&now) << " - " <<  "Old Name: " << nOld << " -> New Name: " << nNew << std::endl;
        log.close();

        // Create old seq files paths string
        oldSeqName.str(nOld);
        oldSeqName << ".seq";
        std::string osn = "./Seq/" + oldSeqName.str();

        // Create new seq files paths string
        newSeqName.str(nNew);
        newSeqName << ".seq";
        std::string nsn = "./renamed/" + newSeqName.str();

        std::ifstream ifseq(osn, std::ios::binary);
        std::ofstream ofseq(nsn, std::ios::binary);

        ofseq << ifseq.rdbuf();

        ifseq.close();
        ofseq.close();

        // Create old ab1 files paths string
        oldAb1Name.str(nOld);
        oldAb1Name << ".ab1";
        std::string oan = "./Seq/" + oldAb1Name.str();

        // Create new abq files paths string
        newAb1Name.str(nNew);
        newAb1Name << ".ab1";
        std::string nan = "./renamed/" + newAb1Name.str();

        std::ifstream ifab1(oan, std::ios::binary);
        std::ofstream ofab1(nan, std::ios::binary);

        ofab1 << ifab1.rdbuf();

        ifab1.close();
        ofab1.close();

    }

    fNew.close();

Answer 1

列表文件在Windows机器上准备好了吗？在这种情况下，它将有DOS行结束(\r\n)，不太适合在Unix上的getline。你看到的字符很可能是\r。在将列表文件输入程序之前，请确保使用dos2unix实用程序。

Answer 2

您可能忘记了trim从getline返回的值，因此它们可能仍然包含空格。应用程序可能很难获取空白空间。