安装rgdal故障

Question

我想安装rgdal for "R version 3.2.3 (2015-12-10)"。我下载并安装了

• GDAL 1.11已完成
• PROJ框架v4.9.2-2
• GEOS框架v3.5.0-1

来自KyngChaos

然后，在RStudio中，我输入了install.packages("rgdal")，它给了我以下内容：

> .... 
> 
> configure: CC: clang configure: CXX: clang++ configure: rgdal:
> 1.1-1 checking for /usr/bin/svnversion... yes configure: svn revision: 
> 572 checking for gdal-config... 
> no no configure: error: gdal-config
> not found or not executable. ERROR: configuration failed for package
> ‘rgdal’
> * removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/rgdal’
> Warning in install.packages :   installation of package ‘rgdal’ had
> non-zero exit status

> sessionInfo()
R version 3.2.3 (2015-12-10)
Platform: x86_64-apple-darwin13.4.0 (64-bit)
Running under: OS X 10.10.5 (Yosemite)

locale:
[1] de_AT.UTF-8/de_AT.UTF-8/de_AT.UTF-8/C/de_AT.UTF-8/de_AT.UTF-8

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):
[1] tools_3.2.3

我也试过在终点站

R CMD INSTALL rgdal_1.1-1.tar --configure-args='--with-gdal-config=/Library/Frameworks/GDAL.framework/Programs/gdal-config
 --with-proj-include=/Library/Frameworks/PROJ.framework/Headers
 --with-proj-lib=/Library/Frameworks/PROJ.framework/unix/lib'

和

sudo R CMD INSTALL –configure-args=’–with-proj-include=/usr/local/lib’ rgdal_1.1-1.tar

没有运气！

Answer 1

终于解决了。

我就是这么做的！OS X 10.10.5 R 3.2.3 GDAL 1.1

1. 从这里下载并安装GDAL完整框架
2. 通过在shell、echo 'export PATH=/Library/Frameworks/GDAL.framework/Programs:$PATH' >> ~/.bash_profile和source ~/.bash_profile中键入以下内容，告诉OS在哪里找到该source ~/.bash_profile文件
3. 通过输入bash gdalinfo --version检查您的GDAL是否正常工作。这应该会带来类似于GDAL 1.11.3, released 2015/09/16的东西。
4. 对于大多数人来说，启动R并输入install.packages("rgdal")是有效的(如果您已经完成了步骤1-3)。然而，对我来说，情况并非如此。所以，如果你仍然有麻烦的话，继续5步。
5. 转到GDAL网站并下载.tar文件。
6. 在shell中，尝试如下：sudo R CMD INSTALL –configure-args=’–with-proj-include=/usr/local/lib’ rgdal_1.1-1.tar。这仍然给了我一个错误：configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations. ERROR: configuration failed for package ‘rgdal’
7. 所以，你得再告诉我在哪里能找到那个。尝试：

R CMD INSTALL rgdal_1.1-1.tar --configure-args='--with-gdal-config=/Library/Frameworks/GDAL.framework/Programs/gdal-config
 --with-proj-include=/Library/Frameworks/PROJ.framework/Headers
 --with-proj-lib=/Library/Frameworks/PROJ.framework/unix/lib'

那应该管用。尝试启动R并在R控制台中键入library(rgdal)。

注意:对于rgoes，我遇到了类似的问题。这帮了我。尝试：

R CMD INSTALL rgeos_0.3-15.tar --configure-args='--with-geos-config=/Library/Frameworks/GEOS.framework/unix/bin/geos-config
--with-proj-include=/Library/Frameworks/PROJ.framework/Headers
--with-proj-lib=/Library/Frameworks/PROJ.framework/unix/lib'

用于指向config文件。在这里，/Library/Frameworks/GEOS.framework/unix/bin/geos-config

Answer 2

在@Stophface先前回答的基础上，快速记录一下可能对某人有用的内容：

我做了上面列出的所有步骤，但是终端的rgdal安装仍然给了我configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations错误。然而(不知道具体原因)，我成功地使用了几乎相同的规范从R.app安装了它：

> install.packages('rgdal', type = "source", configure.args=c(
     '--with-gdal-config=/Library/Frameworks/GDAL.framework/Programs/gdal-config',
     '--with-proj-include=/Library/Frameworks/PROJ.framework/Headers',
     '--with-proj-lib=/Library/Frameworks/PROJ.framework/unix/lib'))

再次感谢你的回答！

Answer 3

我在macOS塞拉利昂上运行R3.4.0 (10.12)时也发生了同样的错误。所以我用自制软件安装了gdal，然后按照R中通常的方式安装了rgdal

在终点站

brew update
brew install gdal

在R中

install.packages("rgdal")

devtools::session_info()
Session info ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 setting  value                       
 version  R version 3.4.0 (2017-04-21)
 system   x86_64, darwin15.6.0        
 ui       RStudio (1.0.143)           
 language (EN)                        
 collate  en_AU.UTF-8                 
 tz       Australia/Melbourne         
 date     2017-04-24                  

Packages --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 package  * version date       source        
 devtools   1.12.0  2016-12-05 CRAN (R 3.4.0)
 digest     0.6.12  2017-01-27 CRAN (R 3.4.0)
 lattice    0.20-35 2017-03-25 CRAN (R 3.4.0)
 memoise    1.1.0   2017-04-21 CRAN (R 3.4.0)
 rgdal    * 1.2-6   2017-04-06 CRAN (R 3.4.0)
 sp       * 1.2-4   2016-12-22 CRAN (R 3.4.0)
 withr      1.0.2   2016-06-20 CRAN (R 3.4.0)