我试图运行3dfim+来计算感兴趣区域的相关映射。我用3drefit -deoblique去倾斜数据(函数和ROI掩码,它被转换成相同的功能空间)(因为我收到了关于数据是斜的错误消息)。然而,去斜面功能图像现在没有时间维度,当从应用于此函数的ROI掩码中提取时间序列时,我得到的一维文件中只有一个数字(884.727 264个体素)。它不应该是每个时间点在ROI中平均体素强度的一列吗?所有的书都去哪了?当我尝试运行3dfim+时,我会收到以下错误:
矩阵错误:向量乘法的不兼容尺寸:0x0X1 **内存使用: chunks=84 bytes=621942标准错误:++ 3dfim+:AFNI version=AFNI_2011_05_26_1457 (2011年6月22日)64位++,作者:B.DouglasWard 3dfim+主返回码:1接口Fim未能运行。
我试图运行的命令是
3dfim+ -input /path/mcorr_001_brain_3drefit.nii.gz -ideal_file /path/mcorr_001_brain_3drefit_maskave.1D -out Correlation -bucket corr_map.nii.gz我试着运行相同的数据,但使用原始的斜数据,并附加于标准:
“警告:如果您在斜dset上执行空间转换,例如/path/roi_sphere_30_21_18_调情.nii.gz,或者查看/组合它与不同倾角的卷,则应该考虑在同一会话中对此和其他斜数据集运行:3 3dWarp -deoblique。”
“矩阵错误:向量乘法的不相容维数:0x0X1”的错误仍然存在,因此似乎不可能是去斜导致了这个问题!
有人知道什么会导致这个问题吗?
发布于 2016-02-04 15:50:46
使用3dinfo检查输入文件(mcorr_001_brain_3drefit.nii.gz),看看它是否有时间轴(TR信息)。如果不是简单地添加一个时间轴与3可怕。
https://stackoverflow.com/questions/33629460
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