在shell脚本中添加包含特殊字符的变量

Question

我正在尝试根据存储在bash脚本中可能包含(、)、[或]的变量中的模式从文件中提取一些行。我使用不包含特殊字符的模式获得所需的输出，但是使用(或)，我得到一个空白输出，而在[或]中，我得到以下错误: grep: range在字符类中的顺序

模式文件示例：

14-3-3-like protein B
14-3-3-like protein B (Fragment)
3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase 2

输入文件示例：

seq1    gi|703124372    380    285    +    2e-154    14-3-3-like protein B    sp
seq2    Q96451    69    51    +    3e-16    14-3-3-like protein B (Fragment)    sp
seq3    P0AAI5    104    84    -    4e-20    3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase 2    sp

我的代码如下：

if [ $@==0 ]
    then echo -e "\nUSAGE: $0 [pattern file] [in file] > [out file]\n"
    exit;
else
    while read line; do
            echo -e "Pattern: $line"
            grep -P "\t$line\t" $2
            echo -e "\n"
    done < $1

产出样本：

Pattern: 14-3-3-like protein B 
seq1    gi|703124372    380    285    +    2e-154    14-3-3-like protein B    sp
Pattern: 14-3-3-like protein B (Fragment)    sp
Pattern: 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase 2
grep: range out of order in character class

我尝试过使用grep -Fw，但这也不能提供所需的输出。我还尝试用\(和\[代替(和[来替换两个输入文件中的模式，但这也不起作用。

你知道我怎么能做到这一点吗？我还有什么可以代替grep的吗？

Answer 1

tab=$(echo -e \\t)
grep -F "$tab$line$tab" $2

编辑:也见@anubhava：grep -F $'\t'"$line"$'\t' "$2"的建议