在OSX上带有g++-5的Cython

Question

我正在使用python 3.4，我将包装一些cpp文件，这些文件使用了一些新的c++语言特性以及openmp，但是，我在使它工作时遇到了一些困难。我使用brew安装了gcc5，我可以很好地编译我的cpp文件。当我试图将它们包装到pyx文件中时，我会得到编译器错误。这是我的setup.py

from distutils.core import setup
from distutils.extension import Extension
from Cython.Build import cythonize
from Cython.Distutils import build_ext
import os

os.environ["CC"] = "/usr/local/Cellar/gcc/5.2.0/bin/g++-5"
os.environ["CXX"] = "/usr/local/Cellar/gcc/5.2.0/bin/g++-5"

modules = [Extension("constellation",
                     ["constellation.pyx"],
                     language="c++",
                     extra_compile_args=["-std=c++1y"])]

for e in modules:
    e.cython_directives = {"embedsignature": True}

setup(name="constellation",
      cmdclass={"build_ext": build_ext},
      ext_modules=modules)

正在运行

python3 setup.py build_ext --inplace

我收到了很多这样的错误：

cc1plus: warning: command line option '-Wstrict-prototypes' is valid for C/ObjC but not for C++
/var/folders/33/vsltc7m51l77bd5qlw3bwxzm0000gn/T//ccuePcPk.s:39:bad register name `%rdi)'
/var/folders/33/vsltc7m51l77bd5qlw3bwxzm0000gn/T//ccuePcPk.s:40:bad register name `%rdi)'
/var/folders/33/vsltc7m51l77bd5qlw3bwxzm0000gn/T//ccuePcPk.s:41:bad register name `%rdi)'
/var/folders/33/vsltc7m51l77bd5qlw3bwxzm0000gn/T//ccuePcPk.s:101:bad register name `%rbx'
...
/var/folders/33/vsltc7m51l77bd5qlw3bwxzm0000gn/T//cca3Gn0U.s:15821:Rest of line ignored. 1st junk character valued 64 (@).
error: command '/usr/local/Cellar/gcc/5.2.0/bin/g++-5' failed with exit status 1

如果我将编译器更改为普通的g++，它可以很好地工作，并使用Apple LLVM version 6.1.0 (clang-602.0.53)进行编译。

有人知道发生了什么吗？构建静态或动态库并将其包装起来更好吗？如果你不知道，我对Cython很陌生。任何建议都是非常感谢的！

Answer 1

我设法把它编译好了。这是我的setup.py，以防它帮助任何有同样问题的人：

from distutils.core import setup
from distutils.extension import Extension
from Cython.Build import cythonize
from Cython.Distutils import build_ext
import os

os.environ["CC"]= "/usr/local/Cellar/gcc/5.2.0/bin/g++-5"
os.environ["CXX"]= "/usr/local/Cellar/gcc/5.2.0/bin/g++-5"
os.environ["MACOSX_DEPLOYMENT_TARGET"]= "10.10"
os.environ["ARCHFLAGS"]= "-arch x86_64"
os.environ["CFLAGS"]= (
    '-I/Users/Thomas/Documents/workspace/Quantum/Symengine '
    '-I/Users/Thomas/Documents/workspace/Quantum/Symengine/symengine '
    '-I/Users/Thomas/Documents/workspace/Quantum/Symengine/symengine/teuchos '
    '-I/Users/Thomas/Documents/workspace/Quantum/SymCell '
    '-I/Users/Thomas/googletest/googletest/include '
    '-I/Users/Thomas/Documents/workspace/Quantum/QuantumCell '
    '\"-I/Users/Thomas/Documents/workspace/Quantum/Quantum CPP\" '
)

extensions = [
    Extension("constellation",
        sources=["constellation.pyx"],
        language="c++",
        extra_compile_args=["-std=c++1y","-fopenmp"],
        extra_link_args=["-fopenmp"])]

setup(
    name = "constellation",
    ext_modules = cythonize(extensions)
)

看起来我的cython没有正确设置，我需要手动设置一些环境变量。特别是，由于某种原因，编译器正在添加-arch i386。显式设置ARCHFLAGS可以消除它。看起来我也可以在c++代码中使用openmp，这是很棒的！交叉我的手指。