变量在shell脚本中未被识别

Question

我使用下面的shell脚本在集群上运行模拟。

  #PBS -N 0.05_0.05_m_1_200k
  #PBS -l nodes=1:ppn=1,pmem=1000mb
  #PBS -S /bin/bash
  #$ -m n
  #$ -j oe


  FOLDER= 0.57

  WDIR=/home/vikas/ala_1_free_energy/membrane_200k/restraint_decoupling_pullinit_$FOLDER

  cd /home/vikas/ala_1_free_energy/membrane_200k/restraint_decoupling_pullinit_$FOLDER

  LAMBDA= 0.05

 /home/durba/gmx455/bin/mdrun -np 1 -deffnm md0.05 -v

 ############################

现在我的问题是我的脚本不识别变量文件夹并抛出一个错误

     couldn't find md0.05.tpr 

存在于文件夹中。如果我在$folder的位置写0.57，它工作得很好，这让我觉得它没有识别变量文件夹。兰博达在两个cases.If中都得到了很好的认可，有人可以在这里帮助我，我将非常感激。

Answer 1

在=和您希望分配给变量的值之间不应该有一个空格：

FOLDER="0.57"

WDIR="/home/vikas/ala_1_free_energy/membrane_200k/restraint_decoupling_pullinit_$FOLDER"

cd "/home/vikas/ala_1_free_energy/membrane_200k/restraint_decoupling_pullinit_$FOLDER"

LAMBDA="0.05"

/home/durba/gmx455/bin/mdrun -np 1 -deffnm md0.05 -v

############################

对于这个例子，我添加的所有双引号""都不是绝对必要的，但是使用它们是一个很好的实践。