使用python的变量参数调用linux命令

Question

我正在尝试从python2x执行一个程序。

在终端中，作业将以下列方式运行：

mpirun -np 8 ~/WORK/scf Fe_SCF.inp > Fe_SCF.out

其中Fe_SCF.*是CWD中的输入和输出。

现在，我试图从python脚本中运行这段代码。此后，我将它们定义为变量，并试图将其调用为：

call(["mpirun -np 8 ~/WORK/scf", scfin,  scfout])

给予错误：

  File "./triolith.py", line 38, in <module>
        call(["mpirun -np 8 ~/WORK/scf", scfin,  scfout])
      File "/usr/lib64/python2.7/subprocess.py", line 522, in call
        return Popen(*popenargs, **kwargs).wait()
      File "/usr/lib64/python2.7/subprocess.py", line 710, in __init__
        errread, errwrite)
      File "/usr/lib64/python2.7/subprocess.py", line 1335, in _execute_child
        raise child_exception
    OSError: [Errno 2] No such file or directory

使用真正的文件名也不能解决这个问题：

 call(["mpirun -np 8 ~/WORK/scf", "Fe_SCF.inp",  "Fe_SCF.out"])

这会产生错误：

File "./triolith.py", line 38, in <module>
    call(["mpirun -np 8 ~/WORK/scf", "Fe_SCF.inp",  "Fe_SCF.out"])
  File "/usr/lib64/python2.7/subprocess.py", line 522, in call
    return Popen(*popenargs, **kwargs).wait()
  File "/usr/lib64/python2.7/subprocess.py", line 710, in __init__
    errread, errwrite)
  File "/usr/lib64/python2.7/subprocess.py", line 1335, in _execute_child
    raise child_exception
OSError: [Errno 2] No such file or directory

我已经检查并可以确认，使用os.system使用的是"Real“文件名，但不使用变量名，如：

 os.system("mpirun -np 8 ~/WORK/scf scfin" )

因此，使用两种方法中的任何一种，我如何用变量名调用程序作为输入和输出？

Answer 1

call获取一个列表，因此您的第一个示例应该是：

cmd = ['/absolute/path/to/mpirun', '-np', '8', '~WORK/scf', var_1]
call(cmd, stdout=var_2, stderr=STDOUT)

Answer 2

在使用OS模块的后一个示例中，您应该能够：

os.system("mpirun -np 8 ~/WORK/scf "+ var_name)

来运行您的函数调用。

对于多个变量，d：

os.system("mpirun -np 8 ~WORK/scf " + var_1 + " " + var_2)