是否可以从neato或GraphViz中提取坐标信息？

Question

一旦生成了一个带有neato的图，是否可以提取出neato计算出的顶点的坐标信息？

我想用这些信息在MATLAB中绘制一个图形；没有任何坐标信息，我就不能使用gplot，而我所拥有的只是邻接矩阵。

目前，我正在用MATLAB绘制一个生物图，然后从该生物图中提取坐标信息，然后再与gplot一起使用，但是它的绘图功能要比neato运行得慢得多，图形布局的质量也要好得多。

有人有什么有用的想法吗？

Answer 1

Graphviz提供了多种输出格式，其中包括dot和xdot。

dot输出格式包含图形及其节点和边的布局信息。如果这还不够的话，xdot将提供更详细的信息，说明graphviz将如何绘制图形。

您可以使用这些输出格式之一(-Tdot参数)调用neato，然后可以解析输出。或者您可以使用gvpr工具(图形、模式、扫描和处理语言)以自定义和易于解析的方式格式化输出(请参阅此示例)。

还请参见这些 答案，例如xdot输出。