Linux中的runjags摘要

Question

我在函数summarise = TRUE中设置了run.jags，然后将输出对象保存为save(out, file="out.RData")。

当我稍后加载这个对象时，我可以检索摘要、情节等。

但是，当我使用完全相同的代码并运行模型，并将输出保存在Linux集群上时，然后在Windows中加载对象以处理该对象，则无法获得摘要和绘图。当我键入summary(out)、print(out)、plot(out)或add.summaries(out)时，会收到以下错误消息：

错误:提供了无效的runjags.object；必须提供runjags函数(包含类'runjags')的输出

即使class(out)返回"runjags"，也是如此。

事实上，names(out)显示输出中没有包括摘要(和许多其他内容)。帮助文件表示默认情况下包括摘要/情节等。

在Linux中运行模型时，是否存在这样的问题：( 1)防止生成摘要，或者( 2)扰乱输出对象的类？

当然，我可以使用coda包并执行out2 <- as.mcmc.list(out)，然后我可以使用coda函数来处理输出。

Answer 1

问题不是Linux (请参阅Matt的评论)，而是runjags的旧版本。我在Linux机器上更新了runjags (好吧，我让系统管理员来做)，这解决了问题。