如何为Rserve提供新的服务？

Question

我需要从rserve开始并继续运行R。

我的rserve.r文件中有以下几行：

library(Rserve)
Rserve()

所以，我试图在我的新贵剧本中做这样的事情：

description "Rserve service"
author      "Valter Silva"

start on filesystem or runlevel [2345]
stop on shutdown

respawn

script
    echo $$ > /var/run/rserve.pid
    exec /usr/bin/R /home/valter/R/rserve.R >> /home/valter/test2.log
end script


pre-start script
    echo "[`date`] Rserve Starting" >> /var/log/rserve.log
end script

pre-stop script
    rm /var/run/rserve.pid
    echo "[`date`] Rserve Stopping" >> /var/log/rserve.log
end script

我知道该服务运行是因为我的文件test2.log的输出。但它只运行过一次。我该怎么做才能让它继续运转？

Answer 1

你(和我)有这么多麻烦的原因是我们问错了问题。正确的问题是“--我们如何从客户端代码启动？”--(和大多数其他客户端)具有StartRserve的能力。

这个问题的答案在于java库：如何从Java自动启动Rserve？。

或者这里是C#库：https://github.com/SurajGupta/RserveCLI2/blob/master/RServeCLI2.Test/Rservice.cs

另一种方法是向最好的学习。Rocker项目将supervisor.conf复制到/etc/supervisor/conf.d/ (参见https://github.com/rocker-org/rocker/blob/master/rstudio/Dockerfile#L61)

您的supervisor.conf可以添加以下内容

[program:Rserve]
command=/usr/bin/Rserve.sh
stdout_logfile=/var/log/supervisor/%(program_name)s.log
stderr_logfile=/var/log/supervisor/%(program_name)s.log
user=myuser
startsecs=0
autorestart=false
exitcodes=0

但是..。我确实想通了。所以这就是答案。我很抱歉它有点笨手笨脚。对我来说，最大的障碍是把我的开始/停止脚本放在/usr/bin文件夹中(参见下面的讨论)

/etc/init/Rserve.conf

description "Rserve service"
author "Victor I. Wood"
version "0.01"

# based on
# https://stackoverflow.com/questions/32485131/how-to-make-an-upstart-service-to-rserve

env STARTSCRIPT=/usr/bin/Rserve.sh
env STOPSCRIPT=/usr/bin/Rserve.stop
env LOGFILE=/var/log/Rserve.log


start on runlevel [2345]
stop on runlevel [!2345]

console output

respawn

# tell upstart we're creating a daemon
# upstart manages PID creation for you.
expect fork


pre-start script
    echo "[`date`] Rserve Starting" >> $LOGFILE
    echo $$ > /var/run/Rserve.pid
end script

pre-stop script
    rm /var/run/Rserve.pid
    echo "[`date`] Rserve Stopping" >> $LOGFILE
    exec $STOPSCRIPT >> $LOGFILE
end script


script
        # My startup script, plain old shell scripting here.
        exec $STARTSCRIPT >> $LOGFILE
#       echo $$ > /var/run/rserve.pid
end script

/usr/bin/Rserve.sh

#!/bin/sh
sudo --login --set-home --user=myuser bash -c '~/Rserve.sh >~/Rserve.log 2>&1'

/usr/bin/Rserve.stop

#!/bin/sh
pkill -U myuser Rserve

/home/myuser/Rserve.sh

#!/bin/sh

# launch new Rserve process
R CMD Rserve --RS-conf /home/myuser/Rserve.conf --no-save >~/Rserve.log 2>&1

https://askubuntu.com/questions/62812/why-isnt-my-upstart-service-starting-on-system-boot?lq=1

我从https://askubuntu.com/questions/62729/how-do-i-set-up-a-service?lq=1的脚本开始，并注意到了initctl的启动，这对于调试可能很有用。

https://askubuntu.com/questions/62812/why-isnt-my-upstart-service-starting-on-system-boot?lq=1注意到脚本必须在/bin中(但我使用了/usr/bin)，并且必须由root拥有。有些人喜欢为脚本i /bin使用指向其他地方脚本的链接

正如如何为Rserve提供新的服务？这里的人所建议的那样，我使用的是在Rserve文档中找到的rServe命令

R CMD Rserve

虽然我已经把我的

R CMD Rserve --RS-conf /home/myuser/Rserve.conf --no-save >~/Rserve.log 2>&1

我没有导出正确的pid，所以我用pkill停止它。一种更优雅的方法是

RSshutdown(rsc)

我怎么才能优雅地关闭Rserve呢？

stdout和stderr混淆了upstart，所以用2>&1 如何将stdout和stderr重定向到文件重定向所有输出。

当我找到https://www.digitalocean.com/community/tutorials/the-upstart-event-system-what-it-is-and-how-to-use-it和https://geeknme.wordpress.com/2009/10/15/getting-started-with-upstart-in-ubuntu/ http://blog.joshsoftware.com/2012/02/14/upstart-scripts-in-ubuntu/时，我就知道了，但是对于那些只想开始工作的人来说，这些地方比正式文档更实用。

更新

此解决方案假定Upstart，这是最初的问题，但Upstart不再是默认的服务管理器。如果您想在后16.04系统上执行此操作，请将其更改为Upstart

sudo apt-get install upstart-sysv
sudo update-initramfs -u
sudo apt-get purge systemd

(来自http://notesofaprogrammer.blogspot.com/2016/09/running-upstart-on-ubuntu-1604-lts.html)

Answer 2

正如Rserve的公共文档所述，您可以从shell脚本启动Rserve守护进程。

只需创建一个执行以下命令的脚本：

echo 'library(Rserve);Rserve(FALSE,args="--no-save --slave --RS-conf <your_own_path>/rserve.conf")'|<R_bin_path>/R --no-save --slave

例如，在我的MacOS计算机中，我可以开始执行以下行：

/bin/sh -c "echo 'library(Rserve);Rserve(FALSE,args=\"--slave\")'|/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/bin/exec/R --no-save --slave"

此命令输出如下所示：

Starting Rserve:
  /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R CMD /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/Rserve/libs//Rserve --slave 

Rserv started in daemon mode.

在启动Rserve时，一定要指定“-从”参数。

您可以创建一个shell脚本(或windows脚本)，并告诉操作系统在启动过程中执行此脚本。