绘制树的时间轴(进化历史)

Question

我目前正在写一篇文献综述，我希望能够通过标出我读过的论文来描绘一些算法的发展过程，以及它们作为水平树被引用的联系，并让x轴对应于出版日期。

这是我要找的东西的一个例子。

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问题

• 这种类型的图形叫什么？
• 是否有现有的工具或示例来生成这种类型的图形？

理想情况下，我希望在R中实现这一点，或者使用D3.js，但是我是灵活的。

注:来自https://stats.stackexchange.com/questions/171715/plotting-a-tree-timeline-evolution-history的交叉邮寄

Answer 1

你所追求的视觉化类型被称为“分支图”，用于分类，或根据共同的特征对生物体进行分类。其他适用于进一步分类的类似视觉化被称为“系统图”或“系统发育树”。

经过一次快速的google之后，我找到了这个R包，ggtree，它似乎做你想做的事情(分支树和标记x轴的潜力，如果你需要的话，甚至y轴)。这个包似乎也允许高度定制的情节。祝好运!