Dicom图像误差

Question

我试图用以下代码读取一个dicom图像：

import dicom
from PIL import Image

Ima = dicom.read_file("MR000000.dcm")

f = Ima.pixel_array

sa = Image.fromarray(f)
sa.show()

但我得到了以下错误：

Traceback (most recent call last):
  File "/usr/lib/python3/dist-packages/PIL/Image.py", line 1926, in fromarray
    mode, rawmode = _fromarray_typemap[typekey]
KeyError: ((1, 1), '<u2')

During handling of the above exception, another exception occurred:

Traceback (most recent call last):
  File "lala.py", line 8, in <module>
    sa = Image.fromarray(f)
  File "/usr/lib/python3/dist-packages/PIL/Image.py", line 1929, in fromarray
    raise TypeError("Cannot handle this data type")
TypeError: Cannot handle this data type

如果有人知道怎么解决，谢谢。

Answer 1

我认为它可能很简单，因为您的版本的PIL不支持16位图像类型。numpy类型的字符串"<u2"是一个"uint16"，这很可能是dicom图像的位深度。如果您使用的是真正的PIL，则可能需要切换到枕头。

Answer 2

我不相信PIL (或枕头)支持DICOM映像，因为它们在支持的文件列表上没有提到。

我以前使用过比迪科姆，它运行得很好。

DICOM是一个复杂的标准。仅仅阅读原始的像素数据(7 FE0,0010)通常是不够的。例如，您可能希望将斜坡(0028,1053)和截取(0028,1052)值应用于原始像素数据，以便得到带有适当单位和偏移量的浮点值。