用多维数组分析RNA序列

Question

目前，我正在学习多维数组，并负责分析.txt序列链(从一个文件中提供)。下面是一条链的例子：

AUGCUUAUUAACUGAAAACAUAUGGGUAGUCGAUGA

考虑到这条线，我要弄清楚RNA链会产生什么样的蛋白质。为了做到这一点，我将把每条链分解成密码子(3组)。所以举个例子，我需要看看AUG，CUU，AAC，UGA，等等，每个密码子代表一个氨基酸。因此，8月是蛋氨酸(用‘M’表示)，CUU是亮氨酸(用‘L’表示)等等。因此，我的输出应该是一串新的氨基酸(M.)

解决这个问题最好的方法是什么？根据我的理解，我要创建一个三维数组，比方说

int aminoAcid[4][4][4]

因为每个碱基有4种可能的选择(A，U，G，C)。不过，我不太确定该从哪里出发，因为某些组合会产生相同的氨基酸。

编辑:如果a首先将字符串转换为数字表示形式(A=0、U=1、G=2、C=3)，我会朝正确的方向前进吗？从那时起，我可以更好地使用三维数组，对吗？

Answer 1

您可以使用3d数组将氨基酸连接到不同的序列。您应该了解enum，并了解如何在数组索引中使用enum，以便您可以执行以下操作

aminoAcid['A']['U']['G'] = 24

其中24也对应于蛋氨酸，这意味着你可以在那里使用另一个enum。每当您有一组有限的已知项要用数字表示时，请使用enums。

听起来这只是一个大型项目的开始，所以您应该从一开始就遵循良好的实践，考虑如何构建代表您的问题的组件。